24小时热门版块排行榜    

查看: 2835  |  回复: 15

有何不可琼

银虫 (著名写手)

[求助] vasp计算较大体系 已有5人参与

有时候,我们需要计算一些比较大的体系,但是奈何集群的运算能力有限。我想问问,用vasp优化结构、计算静态等的时候,出现根本算不动,或者算了一些步骤,然后中途断掉的情况。大家有没有什么小技巧,可以让计算继续。我目前通过减少K点,在INCAR中,将SIGMA改改大一点,将PREC=Accurate改成Normal,阶段能ENCUT稍微降低一些。但是,好像还没有见到非常有效。   想问问这方面的前辈,还有哪些参数可以尝试调整一下,能让计算的效率更高。谢谢各位~

发自小木虫Android客户端
回复此楼
优秀的研究员是自己学出来的
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
有何不可琼(蛋蛋小童鞋代发): 金币+5, 谢谢参与,小木虫鼓励积极回答问题者 2016-11-15 08:33:51
??????????^??
"????R?????????R???????" ?@????????
??????Y???????????????????o???????
?????????Y?????????Y?????淨
??????c????????

1. ?????r?M????????Q??????
??????????Q???k ?c???????????Ч??
???: ???O????????????棬??? 5x5x1 k-points???]????Q????r????? 25 ?? k-points
        ???????? C3V ???????Q??????? 5x5x1???????????? (?? 1/3) ?? k ?????_??

2. ???????????
?@????????????????????????????????Еr??^????????????????????_????K???
??????@?????????????????????

3. ??r?g?Q????g
??????o????????r??????????w???? (????? ??治??)
???: ??????? node?? 8 cores CPU???? memory ?? 32 G
?????r???@?????Y??????? core ?????? 4 G memory
??r??????F??治?????Σ???????~
??????? node ????~ ??? 2 cores???@????? core ?????? 16 G
?????????m????r?g?????L...??~ ???????????Y??

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2016-11-07 18:01:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
有何不可琼(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2016-11-03 16:54:51
先把精度设置的低一些,然后用输出文件覆盖输入的(cp CONTCAR POSCAR),然后再慢慢提高精度,在继续
还有就是对于ISIF的设置也可以实现计算速度的提高。
愿不负最苦的时光
4楼2016-11-03 08:34:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

有何不可琼

银虫 (著名写手)

优秀的研究员是自己学出来的
2楼2016-11-03 07:58:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

有何不可琼

银虫 (著名写手)

优秀的研究员是自己学出来的
3楼2016-11-03 07:58:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

有何不可琼

银虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-11-03 08:34:29
先把精度设置的低一些,然后用输出文件覆盖输入的(cp CONTCAR POSCAR),然后再慢慢提高精度,在继续
还有就是对于ISIF的设置也可以实现计算速度的提高。

好的,那我试试。二维,一般ISIF等于4或者2。

发自小木虫Android客户端
优秀的研究员是自己学出来的
5楼2016-11-03 12:04:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

有何不可琼

银虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-11-03 08:34:29
先把精度设置的低一些,然后用输出文件覆盖输入的(cp CONTCAR POSCAR),然后再慢慢提高精度,在继续
还有就是对于ISIF的设置也可以实现计算速度的提高。

不过,这个方法,要逐步提高精度,只是精度提高之后怕是又算不动了!所以,只能用在测试的时候,最后要得到稳定的结构和精确的结果,不知道能不能做到。

发自小木虫Android客户端
优秀的研究员是自己学出来的
6楼2016-11-03 15:50:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

有何不可琼

银虫 (著名写手)

好的,谢谢分享。我最近发现跟所用的机器关系也很大。

发自小木虫Android客户端
优秀的研究员是自己学出来的
8楼2016-11-07 19:57:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

amaxzhou

金虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

你的服务器是什么配置的?可能配置不高
9楼2016-11-09 10:15:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

有何不可琼

银虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by amaxzhou at 2016-11-09 10:15:09
你的服务器是什么配置的?可能配置不高

我发现我用大集群计算的速度,还不如小集群。我们课题组的大集群总是要排队,投任务的脚本也不一样。结果就是CPU多,速度反而还不如小集群快。感觉我们课题组的大集群完全没有发挥什么价值。

发自小木虫Android客户端
优秀的研究员是自己学出来的
10楼2016-11-09 10:34:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 有何不可琼 的主题更新
信息提示
请填处理意见