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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求求助，水分子上的氢只找到一个，该如何解决
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traven

金虫 (小有名气)

[求助] 求求助，水分子上的氢只找到一个，该如何解决 已有2人参与

在用shelxle解析晶体，里面有一个水分子。但是氧周边只有一个Q 峰，这个该怎么解决？可以用什么command 在氧上加两个氢吗？谢谢了！

[ Last edited by linhua0402313 on 2016-10-26 at 14:57 ]
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走着看着，我想追求我的梦想
1楼 2016-10-26 13:06:09
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看看是不是处于对称位置的水分子，另一个氢对称操作出来

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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
2楼2016-10-26 13:59:26
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traven

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2016-10-26 13:59:26
看看是不是处于对称位置的水分子，另一个氢对称操作出来

请问具体怎么做呢？谢谢了

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走着看着，我想追求我的梦想
3楼2016-10-26 21:39:21
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by traven at 2016-10-26 21:39:21
请问具体怎么做呢？谢谢了
...

用grow，长全结构看

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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
4楼2016-10-26 21:41:24
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wbulu

至尊木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
通常认为，水分子不会孤立的存在，应该存在H键相互作用，H键必须有给体和受体，不然checkcif会给出A或B类错误。目前水分子大概有三种方法可以加H，有时候比较烦，一个游离水可能加氢需要几个小时，当然这是不好弄的例子。好弄的几分钟。
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5楼2016-10-27 13:53:18
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traven

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wbulu at 2016-10-27 13:53:18
通常认为，水分子不会孤立的存在，应该存在H键相互作用，H键必须有给体和受体，不然checkcif会给出A或B类错误。目前水分子大概有三种方法可以加H，有时候比较烦，一个游离水可能加氢需要几个小时，当然这是不好弄的 ...

请问是哪三种方法呢？

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走着看着，我想追求我的梦想
6楼2016-10-27 20:22:24
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wbulu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by traven at 2016-10-27 20:22:24
请问是哪三种方法呢？
...

三种方法是我自己总结的，不一定对，青椒一个，有不同意见，欢迎交流。1是 WINGX加H，网上有教程，2是Mecury加H，3是shelxtl中的XP加H，这三种方法，前两种自动化较高，偶尔会出错，第三种手动，通常我会结合着搞。
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7楼2016-10-28 09:36:39
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