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莫伊2013

银虫 (小有名气)

[求助] SSR新手求指导 已有2人参与

本人刚开始做基因QTL定位，目前已从亲本中筛选出具有多态性的引物。F2群体已经构建，现在用多态的引物扫描F2群体。F2群体DNA提取浓度较低，大概在20到150纳克每微升，扫描F2群体时有些引物出带有些引物没带，请大家看下是什么原因？

SSR新手求指导
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1楼 2016-10-21 10:07:08
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莫伊2013

银虫 (小有名气)
没有人呢？
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2楼2016-10-23 08:34:06
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墨香扉雪

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
莫伊2013: 金币+30 2016-11-24 13:02:40
没条带就是没有扩增出来，还有，可能是试验中引物，模板没有加好，我们做实验也经常出现这种问题，但是你的条带很重，PCR产物浓度足够了，还有，你的胶上面部分有阴影，应该是PCRmix中的染料被染色了，我之前做的也这样。
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若我有心，莫辜负曾有的才华。
3楼2016-11-08 15:51:04
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star013

新虫 (知名作家)
我们可以提供该实验技术服务

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4楼2016-11-08 17:02:49
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shiguanglii

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

理论上，SSR体系中DNA样本有10纳克每微升就够用了，你其他的条带很深，证明浓度足够了，无条带的甬道从上至下都很干净，看看是否是其他问题
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5楼2016-11-23 16:36:01
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moon river

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 墨香扉雪 at 2016-11-08 15:51:04
没条带就是没有扩增出来，还有，可能是试验中引物，模板没有加好，我们做实验也经常出现这种问题，但是你的条带很重，PCR产物浓度足够了，还有，你的胶上面部分有阴影，应该是PCRmix中的染料被染色了，我之前做的也 ...

我也用的mix  也是染料被染色了吗 怎么解决呢   麻烦了
SSR新手求指导-1



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6楼2016-12-17 07:18:00
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三月青衣

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by moon river at 2016-12-17 07:18:00
我也用的mix  也是染料被染色了吗 怎么解决呢   麻烦了

...

筛的引物不好吧，感觉条带差异不明显呢?
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7楼2017-03-21 16:47:50
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