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莫伊2013

银虫 (小有名气)

[求助] SSR新手求指导 已有2人参与

本人刚开始做基因QTL定位,目前已从亲本中筛选出具有多态性的引物。F2群体已经构建,现在用多态的引物扫描F2群体。F2群体DNA提取浓度较低,大概在20到150纳克每微升,扫描F2群体时有些引物出带有些引物没带,请大家看下是什么原因?

SSR新手求指导
IMG_20161020_170334.jpg
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莫伊2013

银虫 (小有名气)

没有人呢?
2楼2016-10-23 08:34:06
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墨香扉雪

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
莫伊2013: 金币+30 2016-11-24 13:02:40
没条带就是没有扩增出来,还有,可能是试验中引物,模板没有加好,我们做实验也经常出现这种问题,但是你的条带很重,PCR产物浓度足够了,还有,你的胶上面部分有阴影,应该是PCRmix中的染料被染色了,我之前做的也这样。
若我有心,莫辜负曾有的才华。
3楼2016-11-08 15:51:04
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star013

新虫 (知名作家)


我们可以提供该实验技术服务

发自小木虫Android客户端
4楼2016-11-08 17:02:49
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shiguanglii

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

理论上,SSR体系中DNA样本有10纳克每微升就够用了,你其他的条带很深,证明浓度足够了,无条带的甬道从上至下都很干净,看看是否是其他问题
5楼2016-11-23 16:36:01
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moon river

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 墨香扉雪 at 2016-11-08 15:51:04
没条带就是没有扩增出来,还有,可能是试验中引物,模板没有加好,我们做实验也经常出现这种问题,但是你的条带很重,PCR产物浓度足够了,还有,你的胶上面部分有阴影,应该是PCRmix中的染料被染色了,我之前做的也 ...

我也用的mix  也是染料被染色了吗 怎么解决呢   麻烦了
SSR新手求指导-1



发自小木虫Android客户端
6楼2016-12-17 07:18:00
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三月青衣

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by moon river at 2016-12-17 07:18:00
我也用的mix  也是染料被染色了吗 怎么解决呢   麻烦了

...

筛的引物不好吧,感觉条带差异不明显呢?
7楼2017-03-21 16:47:50
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