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怎样用一段基因和基因组的序列进行比对呢?
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求助:我想要做一个苜蓿的基因定量,可是没有序列不能设计引物,所以想拿拟南芥的这个基因和苜蓿的基因组进行比对,得到序列后设计引物,可是不知道这么做对不对,还有不知道怎么比对?如果想法不对请知道的大神指点!急急急!有谁知道请帮忙,万分感谢! 发自小木虫Android客户端 |
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ygidtu
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就是那拟南芥的那个基因,去匹配苜蓿的基因组,blast出来的相似性高的应该就是么,如果所有数据都在你本地,你可以本地跑一个看看。毕竟如果你在线的不好,本地跑一下我感觉更能确定原因。 发自小木虫Android客户端 |
13楼2016-10-16 20:39:57
ygidtu
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2楼2016-10-16 19:38:15
ygidtu
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3楼2016-10-16 19:39:29
李保磊
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-10-16 22:22:38
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-10-16 22:22:38
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可以先去NCBI将苜蓿的序列全部下载下来,然后blast,这样才可靠,你要是拟南芥的话,必须找一些保守区域,也有可能出现问题,而且费些时间 发自小木虫Android客户端 |
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4楼2016-10-16 19:42:20














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菱紫369