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皮蛋同学

新虫 (小有名气)

[求助] 连接-滚环扩增做了两个月只做出来一次,求大神指导! 已有2人参与

最近在做连接-滚环扩增,做了两个月了,只做出来了一次。实验菜鸟求大神指导T-T



20ul 连接体系:10uM 锁式探针 4ul,10uM 目标物 2ul,10Xbuffer 2ul,T4连接酶 4U。 PCR仪 22度 1h,65度灭活10min。



10ul 连接产物加入 10ul 外切酶混合物,37度孵箱孵育 1h,水浴85度灭活 15min。



20ul 酶切产物加入引物4 ul(200nM),Bst 酶 16U, buffer 4ul,dNTP 3.2ul, 水6.8ul, 水浴65度 2h


所有序列都是公司合成的,实验期间换过序列,换过酶,换过温度和时间,都做不出来。直到最近才做出来过一次,电泳出来有阶梯状条带,肉眼没有絮状物。(听师姐说他们做的滚环扩增都会出现肉眼可见絮状物,效果好的半小时就能出现)但之后又做过几次,酶切后和扩增后的样本电泳均没有任何条带。


现在有几个问题,一是请各位大神看看我的实验方法有没有错误,二是请问滚环扩增都能出现肉眼可见的絮状物吗?三是如果酶切后无电泳条带,是不是就意味着连接失败(理论上成环后应该是不能被酶切的)。实验拖了两三个月了,跪求大神指导T-T
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baichi121234

禁虫 (职业作家)

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5楼2016-11-03 17:11:36
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Xuanxuan

新虫 (初入文坛)

2楼2016-10-13 16:45:08
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艳子92

新虫 (小有名气)

我最近也在做滚环,也是挺长时间没做出来,大家一起交流一下吧

发自小木虫Android客户端
3楼2016-10-17 09:21:22
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perfectyp

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

酶切后肯定要电泳验证呀,你没条带肯定是环没做好,环做起来很麻烦,最好委托公司合成,而且你酶切电泳验证后最好做纯化,否则bst扩增会特异性不好,滚环扩增我觉得很简单,做过两次,不过我用的是vent酶
4楼2016-11-03 16:46:22
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盐津咖啡豆

新虫 (初入文坛)

6楼2017-04-01 23:12:46
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盐津咖啡豆

新虫 (初入文坛)

T4连接酶反应温度是16度 都是过夜

发自小木虫IOS客户端
7楼2017-04-01 23:13:22
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盐津咖啡豆

新虫 (初入文坛)

连环那一步时间要长一点 你的时间短了吧

发自小木虫IOS客户端
8楼2017-04-01 23:13:47
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amber流河

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我的会产生絮状物 而且因为用的是荧光检测 絮状产物对检测的效果的影响极大 每天都要崩溃了 可以交流一下
9楼2017-04-24 10:31:06
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我不是分割线

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by amber流河 at 2017-04-24 10:31:06
我的会产生絮状物 而且因为用的是荧光检测 絮状产物对检测的效果的影响极大 每天都要崩溃了 可以交流一下

我也做出来有絮状物,然后用DNA产物回收试剂盒纯化后测有荧光,但是电泳却没有条带,师兄说是纯化后浓度降低了。而且我后面又做了一次,加了外切酶酶切,反应时间缩短后产物就不粘稠了,测荧光值也还可以,但是没有之前那么高

发自小木虫IOS客户端
10楼2017-11-09 17:13:34
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