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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » msi2lmp转data
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guozhijing

银虫 (初入文坛)

[求助] msi2lmp转data 已有3人参与

选取力场为pcff,在Lammps中用msi2lmp转data时出现
   Get force field parameters for this system
    Unable to find bondbond data for cp c2 cp
请问是什么原因呢？@smutao
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人生最精彩的不是实现梦想的瞬间，而是坚持梦想的过程
1楼 2016-10-10 21:02:07
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
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14楼2016-10-15 23:46:17
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guozhijing

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
16楼: Originally posted by 团小暖 at 2016-10-17 19:06:44
我不是额
...

你是在做拉伸吗，可以聊聊吗

发自小木虫Android客户端
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人生最精彩的不是实现梦想的瞬间，而是坚持梦想的过程
17楼2016-10-18 08:57:34
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记忆的拾荒者

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
pcff应该是第二代力场吧
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2楼2016-10-10 21:14:18
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一次性保温杯

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
建议你在输出msi文件之前把bond都删除掉，这样应该可以成功。但是输出的lmp文件只有原子坐标，没有键的信息
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3楼2016-10-10 21:39:51
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guozhijing

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 记忆的拾荒者 at 2016-10-10 21:14:18
pcff应该是第二代力场吧

是的
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人生最精彩的不是实现梦想的瞬间，而是坚持梦想的过程
4楼2016-10-10 21:40:17
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guozhijing

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 一次性保温杯 at 2016-10-10 21:39:51
建议你在输出msi文件之前把bond都删除掉，这样应该可以成功。但是输出的lmp文件只有原子坐标，没有键的信息

这样不太合理吧
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人生最精彩的不是实现梦想的瞬间，而是坚持梦想的过程
5楼2016-10-10 22:22:33
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一次性保温杯

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by guozhijing at 2016-10-10 06:22:33
这样不太合理吧...

看你什么用途咯
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6楼2016-10-10 22:57:32
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guozhijing

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 一次性保温杯 at 2016-10-10 22:57:32
看你什么用途咯...

我要在lammps中做拉伸

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人生最精彩的不是实现梦想的瞬间，而是坚持梦想的过程
7楼2016-10-10 23:21:02
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一次性保温杯

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by guozhijing at 2016-10-10 07:21:02
我要在lammps中做拉伸
...

好吧，这是个问题，如果没有bond的话，模拟好像不对，坐等大神来解答吧
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8楼2016-10-11 10:33:11
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chenbo3088

银虫 (小有名气)
可以讨论下不，我也做拉伸

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9楼2016-10-12 22:37:33
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biancheng159

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果所得data文件包含了大部分拓扑信息，则可加-i参数忽略掉报错信息即可。
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so,hu r u?
10楼2016-10-13 09:35:42
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