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连雨飘

银虫 (小有名气)

[交流] 求解 如何找到基因的UTR 已有4人参与

如题,本人在甘蔗里克隆一个基因,先基本找到启动子与终止子的位置,想往上下游找到5’和3’UTR,有什么软件或网站可以预测吗?注意:甘蔗的基因组还没测序,所以什么NCBI直接找基因的方法肯定不行,也不想用RACE的方法或者tail-PCR,有点麻烦。求大神给与赐教!
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starseacow

专家顾问 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
race大概是最简单的方法了
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
3楼2016-10-13 00:22:02
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lixg

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
既然不想做race, 那就请现构建cDNA文库,然后平板杂交,对杂交阳性的克隆测序吧。(其实比race更复杂)
2楼2016-10-10 17:54:28
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Harper_sun

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
嗯,看了你的想法觉得你可以直接靠猜了,然后还可以发N。。

发自小木虫Android客户端
4楼2016-10-13 08:24:26
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jinnini125

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
哈哈哈,楼主不要太想省事啊

发自小木虫IOS客户端
5楼2016-12-17 13:43:07
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