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天下为公5592

铜虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】新手请教分子模拟问题已有5人参与

我想做氨基酸或多肽在方解石表面的动力学模拟，用哪个软件比较好？

我只知道人家有用Material Studio做模拟的。

还有个问题是：蒙特卡罗模拟到底是用什么软件？是自己编程的吗？

谢谢指点！

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-14 at 14:19 ]

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1楼 2008-11-23 08:42:10

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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

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★
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引用回帖:

Originally posted by dellus at 2011-03-25 04:56:59:
不知道Stochastic Dynamic和通常MD中所说的动力学有何异同，还请yahoohoo兄指教一下

, 指教不敢当。大家一起聊天罢了。

拿最简单的Ising模型来说，MC就是用来研究相分离动力学的很好的方法。

再比如说高分子稀溶液的动力学也完全可以用MC来做，只是你在选择MC算法的时候不能用unphysical的。

如果你用MD结合一些含有随机力项的热浴，那么你考虑的实际上也是随机动力学。高分子链在稀溶液中受到周围溶剂的随机碰撞，这也是随机动力学。

仅个人愚见。