| 查看: 2899 | 回复: 4 | |||
[求助]
miRNA与靶基因3'UTR区的SNP结合能的预测
|
|
最近在对miRNA与靶基因3'UTR区的SNP结合能的预测, 想了解靶基因3'UTR区SNP不同等位位点与同一miRNA结合, 其结合能的差异. 看到一篇IF=5分多的文献, 用的是Thermodynamic model, 结果如图,附件. 由于知识有限, 我折腾了好些天都搞不清楚, 文献Minimum Free Energy (MFE)是怎么算的, 也不懂它的图怎么画出来。另外，图二，大家知道用哪个网页或者软件得到的吗？ 希望得到各位大神的帮助! 如果大家有更好的方法 ,也欢迎分享,谢谢!~~ 以下是图中符号的标注 EIntermediate is the energy necessary to make the target region accessible for miRNA binding, EComplex is the energy of miRNA–target complex. The activation energy, E(a), is represented by the difference between EIntermediate and ETarget, whereas the binding energy, E(b), is the difference between EComplex and ETarget  图1.png  图2.png |
回复此楼» 猜你喜欢
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有165人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- miRNA，mRNA，蛋白质之间表达的关系求助
已经有3人回复
- 确定miRNA与靶基因相互作用
已经有10人回复
- 吃啥补啥的科学原理：中药经煎煮后进入人体的除了化学成分还有什么？
已经有10人回复
- 3'UTR载体构建问题
已经有1人回复
- miRNA与靶基因不反向互补怎么办
已经有0人回复
- 今天做了个双荧光，出现了比较诡异的结果。。。
已经有5人回复
- miRNA与靶基因
已经有2人回复
- 《实验医学》JEM May 2013 文章精选(附全文下载)
已经有2人回复
- 求翻译一段（汉译英）（分子生物学专业）
已经有6人回复
- mircoRNA对特定靶细胞基因的mRNA的作用机制
已经有1人回复
- 世界级美女科学家Nature文章解析miRNA----ebio
已经有19人回复
寻找1
新虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2249.1
- 散金: 100
- 帖子: 577
- 在线: 139.6小时
- 虫号: 4453607
- 注册: 2016-03-01
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
2楼2016-09-22 12:03:43
|
图1是来自附件1的文献，图2来自附件2文献的补充文件（附件3） |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : An_NTD_associated_polymorphism_in_th_Source_Hum_Mutat_SO_2014_Jan_35_1_96_104PMIDT-human_mutation.pdf
- 附件 2 : Cancer_Res-2010-Nicoloso-2789-98.pdf
- 附件 3 : CR-stab_2.pdf
2016-09-22 15:20:20, 1.27 M
2016-09-22 15:21:03, 449.54 K
2016-09-22 15:21:35, 2 M
3楼2016-09-22 15:23:31
4楼2016-09-22 15:35:48
5楼2019-05-29 23:17:11
100