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雪之汐若

银虫 (小有名气)

[求助] 长片段PCR问题 已有4人参与

要从斑马鱼基因组DNA上扩增一个大约6K左右的片段
尝试了实验室所有的酶,Taq,KOD,KODneo……但是直接扩增均失败
有了一个新的思路,把6K分成3个2K 的片段,用Overlap PCR最后连接在一起,但是小片段扩增成功,测序也是正确的,没有办法用Overlap PCR的方式融合在一起,不知道是出了啥状况,大家都有啥好的建议。
或者说有没有相关从基因组上扩增长片段的经验,好用的酶或者Kit之类的,感激不尽,祝大家科研天天出成果@biostar2009@飞约疯人院@wizardfan@youlinglyw
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因为有了我而让这个世界有一点点的不一样
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zhangyunjing

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by 雪之汐若 at 2016-09-06 17:58:11
有什么好的kit吗?
...

我用过的生工生物工程(上海)股份公司的 Long and Accurate PCR Kit,以人的基因组DNA为模板,扩增过长度为15 kb的片段,扩增效果还是不错的。你可以试试。
rainwater
16楼2016-09-07 14:15:10
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010308Jing

木虫 (正式写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-06 08:22:31
你做overlap PCR两个两个分开做的吗?还是三个一起?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-09-05 19:01:17
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更恋秋风

铁杆木虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-09-05 22:36:43
6k应该是可以pcr的,如果是直接pcr可以尝试第一步的预变形时间延长到15min,酶可以试试NEB的Q5聚合酶。如果是直接分段pcr然后overlap pcr,实际上是不太容易连接的,可以试试其他连接手段,比如一步克隆。

发自小木虫Android客户端
4楼2016-09-05 19:08:40
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MMCCBB

新虫 (著名写手)

xn8008: 欢迎发帖交流 2016-09-06 08:22:38
买全是金的HiFi酶试试

发自小木虫IOS客户端
5楼2016-09-05 19:47:42
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