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【求助】计算过渡态,优化初始反应物遇到困难请帮忙!
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想计算一个质子氢参与的化学反应。第一个定点应该是质子氢和反应物放在一起优化结构。因为是能量图中的初始定点,要求氢离子和反应分子没有相互作用,所以放置位置设置为3埃,发现优化以后,氢离子和我的分子中带有负电荷的原子成键了(这重情况在计算带有电荷的离子解离开的时候也发生过,依然没有解决)。调节距离后(6埃),优化结构依然错误,输出文件提示如下: >>>>>>>>>> Convergence criterion not met. SCF Done: E(RB+HF-LYP) = -132.764483473 A.U. after 129 cycles Convg = 0.1330D-01 -V/T = 2.0229 S**2 = 0.0000 Convergence failure -- run terminated. Error termination via Lnk1e in /home/majun/gaussian03/g03/l502.exe at Wed Nov 19 00:45:40 2008. Job cpu time: 0 days 0 hours 2 minutes 2.6 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 11 Int= 0 D2E= 0 Chk= 4 Scr= 1 因为是第一次计算带有电荷的原子参与的反应过渡态,所以很困惑。请高手帮忙指点一下。 还有就是在计算反应过程中,对A+B-->C+D的反应,感觉初始能量计算时候要优化A+B的时候(把两个分子放到一个输入文件中),比较困难。其中一个部分是带有电荷的(比如说金属原子),电荷要固定一下吗(也就是指定电荷都在这个金属原子上)? 初始的能量是不是也可以用A和B的单独的能量计算加和?我要是想A+B放在一起,为后面用QST2粗略的找过渡态方便。 |
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9楼2008-11-21 09:29:28
dolphin618
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