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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】计算过渡态，优化初始反应物遇到困难请帮忙！
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】计算过渡态，优化初始反应物遇到困难请帮忙！

想计算一个质子氢参与的化学反应。第一个定点应该是质子氢和反应物放在一起优化结构。因为是能量图中的初始定点，要求氢离子和反应分子没有相互作用，所以放置位置设置为3埃，发现优化以后，氢离子和我的分子中带有负电荷的原子成键了（这重情况在计算带有电荷的离子解离开的时候也发生过，依然没有解决）。调节距离后（6埃），优化结构依然错误，输出文件提示如下：
>>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
SCF Done:  E(RB+HF-LYP) =  -132.764483473     A.U. after  129 cycles
             Convg  =    0.1330D-01             -V/T =  2.0229
             S**2   =   0.0000
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /home/majun/gaussian03/g03/l502.exe at Wed Nov 19 00:45:40 2008.
Job cpu time:  0 days  0 hours  2 minutes  2.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     11 Int=      0 D2E=      0 Chk=      4 Scr=      1

因为是第一次计算带有电荷的原子参与的反应过渡态，所以很困惑。请高手帮忙指点一下。
还有就是在计算反应过程中，对A＋B－－>C＋D的反应，感觉初始能量计算时候要优化A＋B的时候（把两个分子放到一个输入文件中），比较困难。其中一个部分是带有电荷的（比如说金属原子），电荷要固定一下吗（也就是指定电荷都在这个金属原子上）？
初始的能量是不是也可以用A和B的单独的能量计算加和？我要是想A＋B放在一起，为后面用QST2粗略的找过渡态方便。
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乐观、执着、勤奋
1楼 2008-11-19 01:04:28
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cysqxr

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):谢谢你!
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
从你的描述看应该是有关于吸附的问题（我猜的不对就算了啊）具体的吸附距离是多少要根据实际情况判断  另外你说的电荷 我知道的范围内好像不可以单独固定把电荷加在某个原子上 如果加的话 就是整体加
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3楼2008-11-19 08:24:24
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dolphin618

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
majun04(金币+2,VIP+0):谢谢你，我加上试试。
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
3埃，感觉距离小了点，其实10埃我觉得可以，优化的时候加上scf=qc试试
赞一下(12人) 回复此楼
生命本就是不可名说的缘法，可又有谁愿做菩提下微笑拈起的莲花？
2楼2008-11-19 03:47:39
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dongyuhui

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
majun04(金币+1,VIP+0):谢谢你，我加大距离看看怎么样。
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
同意楼上的说法，楼主可以试一下把距离变大，我以前改了距离就好了
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快乐的心
4楼2008-11-19 08:51:28
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majun04

木虫 (著名写手)

majun
引用回帖:
Originally posted by cysqxr at 2008-11-19 08:24:
从你的描述看应该是有关于吸附的问题（我猜的不对就算了啊）具体的吸附距离是多少要根据实际情况判断  另外你说的电荷 我知道的范围内好像不可以单独固定把电荷加在某个原子上 如果加的话 就是整体加

我计算的不是吸附问题，是质子酸催化反应过渡态的寻找，现在是多个过渡态的寻找。设计到首先是氢离子进行亲电子进攻，然后发生一系列的变化以后，氢离子再脱离到溶液中去。
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乐观、执着、勤奋
5楼2008-11-19 08:58:05
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