| 查看: 891 | 回复: 9 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】计算过渡态，优化初始反应物遇到困难请帮忙！
|
|||
|
想计算一个质子氢参与的化学反应。第一个定点应该是质子氢和反应物放在一起优化结构。因为是能量图中的初始定点，要求氢离子和反应分子没有相互作用，所以放置位置设置为3埃，发现优化以后，氢离子和我的分子中带有负电荷的原子成键了（这重情况在计算带有电荷的离子解离开的时候也发生过，依然没有解决）。调节距离后（6埃），优化结构依然错误，输出文件提示如下： >>>>>>>>>> Convergence criterion not met. SCF Done: E(RB+HF-LYP) = -132.764483473 A.U. after 129 cycles Convg = 0.1330D-01 -V/T = 2.0229 S**2 = 0.0000 Convergence failure -- run terminated. Error termination via Lnk1e in /home/majun/gaussian03/g03/l502.exe at Wed Nov 19 00:45:40 2008. Job cpu time: 0 days 0 hours 2 minutes 2.6 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 11 Int= 0 D2E= 0 Chk= 4 Scr= 1 因为是第一次计算带有电荷的原子参与的反应过渡态，所以很困惑。请高手帮忙指点一下。 还有就是在计算反应过程中，对A＋B－－>C＋D的反应，感觉初始能量计算时候要优化A＋B的时候（把两个分子放到一个输入文件中），比较困难。其中一个部分是带有电荷的（比如说金属原子），电荷要固定一下吗（也就是指定电荷都在这个金属原子上）？ 初始的能量是不是也可以用A和B的单独的能量计算加和？我要是想A＋B放在一起，为后面用QST2粗略的找过渡态方便。 |
回复此楼» 猜你喜欢
淮北师范大学 化学与化工科学学院2026年硕士研究生招生 调剂信息公告
已经有1人回复
-
淮北师范大学 化学与化工科学学院 电催化课题组还有1名硕士研究生招生名额
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有229人回复
-
化学相关硕士研究生招收调剂-湖北师范大学 （快来捡漏，最新调剂信息，过国家线即可）
已经有1人回复
-
河南理工大学化学化工学院招收学硕调剂生
已经有0人回复
-
黑龙江科技大学化工 环境工程调剂
已经有22人回复
-
莆田学院环境与生物工程学院资源与环境专硕（环境工程方向） 开放调剂招生
已经有13人回复
-
浙江海洋大学石油化工与环境学院招收工科调剂生（学硕、专硕均可，线上面试）
已经有0人回复
-
浙江海洋大学石油化工学院接收工科调剂（学硕、专硕均可，近期线上面试）
已经有8人回复
-
浙江海洋大学石油与天然气工程专业接收工科调剂（13日早上截止，线上面试）
已经有0人回复
-
考研调剂～湖南工程学院材料与化工学院
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
dolphin618
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1206.3
- 散金: 1756
- 帖子: 624
- 在线: 106小时
- 虫号: 211713
- 注册: 2006-03-08
- 性别: GG
- 专业: 能源化工
2楼2008-11-19 03:47:39
3楼2008-11-19 08:24:24
4楼2008-11-19 08:51:28
5楼2008-11-19 08:58:05
6楼2008-11-19 16:02:49
zhangji3013
金虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1313
- 散金: 63
- 帖子: 232
- 在线: 107.5小时
- 虫号: 532956
- 注册: 2008-03-25
- 专业: 物理有机化学
7楼2008-11-20 09:08:37
8楼2008-11-20 09:23:30
9楼2008-11-21 09:29:28
★ ★ ★ ★ ★
majun04(金币+5,VIP+0):谢谢你的帮助！
majun04(金币+5,VIP+0):谢谢你的帮助！
|
我说一下自己的看法 单独的用质子与其他物质作用，这个模型不是很合理。通常要做质子与其他的分子作用，需要把质子溶剂化（例如采用水合氢离子H3O+），然后你做计算就不会出现不收敛的问题了。l502的错误意味着你的结构出现了很不合理的情况，像你这种单独解离质子的，把质子离得太远以后，化学上来说就没有电子了，这在量化中很难处理。即使你使用了scf=qc也不会有所改变。看看你的反应体系，采用相应的溶剂来处理你的质子。 另外呢，如果目标分子已经被质子化了，接着再发生其他反应的情况，可以把溶剂分子去掉了做（如果溶剂分子不再参与反应）。 [ Last edited by cysqxr on 2008-11-28 at 11:00 ] |
10楼2008-11-28 10:58:40
