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【求助】计算过渡态，优化初始反应物遇到困难请帮忙！
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想计算一个质子氢参与的化学反应。第一个定点应该是质子氢和反应物放在一起优化结构。因为是能量图中的初始定点，要求氢离子和反应分子没有相互作用，所以放置位置设置为3埃，发现优化以后，氢离子和我的分子中带有负电荷的原子成键了（这重情况在计算带有电荷的离子解离开的时候也发生过，依然没有解决）。调节距离后（6埃），优化结构依然错误，输出文件提示如下： >>>>>>>>>> Convergence criterion not met. SCF Done: E(RB+HF-LYP) = -132.764483473 A.U. after 129 cycles Convg = 0.1330D-01 -V/T = 2.0229 S**2 = 0.0000 Convergence failure -- run terminated. Error termination via Lnk1e in /home/majun/gaussian03/g03/l502.exe at Wed Nov 19 00:45:40 2008. Job cpu time: 0 days 0 hours 2 minutes 2.6 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 11 Int= 0 D2E= 0 Chk= 4 Scr= 1 因为是第一次计算带有电荷的原子参与的反应过渡态，所以很困惑。请高手帮忙指点一下。 还有就是在计算反应过程中，对A＋B－－>C＋D的反应，感觉初始能量计算时候要优化A＋B的时候（把两个分子放到一个输入文件中），比较困难。其中一个部分是带有电荷的（比如说金属原子），电荷要固定一下吗（也就是指定电荷都在这个金属原子上）？ 初始的能量是不是也可以用A和B的单独的能量计算加和？我要是想A＋B放在一起，为后面用QST2粗略的找过渡态方便。 |
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majun04(金币+5,VIP+0):谢谢你的帮助！
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我说一下自己的看法 单独的用质子与其他物质作用，这个模型不是很合理。通常要做质子与其他的分子作用，需要把质子溶剂化（例如采用水合氢离子H3O+），然后你做计算就不会出现不收敛的问题了。l502的错误意味着你的结构出现了很不合理的情况，像你这种单独解离质子的，把质子离得太远以后，化学上来说就没有电子了，这在量化中很难处理。即使你使用了scf=qc也不会有所改变。看看你的反应体系，采用相应的溶剂来处理你的质子。 另外呢，如果目标分子已经被质子化了，接着再发生其他反应的情况，可以把溶剂分子去掉了做（如果溶剂分子不再参与反应）。 [ Last edited by cysqxr on 2008-11-28 at 11:00 ] |
10楼2008-11-28 10:58:40
dolphin618
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2楼2008-11-19 03:47:39
3楼2008-11-19 08:24:24
4楼2008-11-19 08:51:28
