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lvyanniwin木虫 (正式写手)
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[交流]
[求助]关于insightII中分子动力学模拟条件一说
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文献《Structural Molecular Dynamics Studies on Polyamidoamine Dendrimers for a Therapeutic Application: Effects of pH and Generation》中采取的条件是非截断值，距离介电常数条件，其中有这样一句话：We changed the vacuum dielectric constant (D ) 1) to the distant-dependent dielectric constant (D ) r) and compared the results with the data from simulations with water.可是这个r到底是怎么计算出来的？ [ Last edited by zdhlover on 2009-12-14 at 14:17 ] |
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lvyanniwin
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4楼2008-11-18 20:42:17
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lvyanniwin(金币+2,VIP+0):虽然没明白，但是人是个好人。
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
lvyanniwin(金币+2,VIP+0):虽然没明白，但是人是个好人。
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
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这个distant-dependent dielectric constant 是一个参数选项，是一个checked box类型的选择参数，而并不是一个需要填入的参数，这也意味着这个参数不用你手工干预计算，InsightII他自己知道该取个什么值。具体的这个值是多少，我也不清楚，还真没注意过，呵呵。估计仔细翻一下Tutorial应该有 求楼主把这篇 文献发给我看一下，谢谢了！ gaiwei@hotmail.com [ Last edited by gwdavid on 2008-11-18 at 20:42 ] |
2楼2008-11-18 20:36:39
gwdavid
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3楼2008-11-18 20:40:04
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5楼2008-11-18 20:43:31