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流感病毒RNA,反转录 已有2人参与
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菜鸟我生物本科学历,今年6月初开始的测定流感病毒HA,NA的序列工作。因之前专门到做此试验的专业部门去学习过,试剂盒都按学习时采购的。我们的大概流程是:病毒总RNA的提取,反转录,cDNA扩增(PCR),电泳鉴定。。。。。。为什么至写到这里,因为只做到这,就遇到问题,无法向下开展了。 问题: 总的问题:没有得到目的条带(HA:1700bp,NA:1400bp) 提取RNA是用试剂盒提取的,有三条亮带,前两条比较亮。 反转录PCR扩增后,得到的片段多为250bp左右的小片段,没得到1700bp啊~ 多次调整退火温度,甚至更换新的引物(学习时,相同毒种可以P出来的引物),都没有得到目的条带。菜鸟我实在分析不出原因~ 求助大神予以指导啊~~~此外,菜鸟还有些问题求助大神们: 问题1:学习时测序所用流感毒种取自于鸡胚尿囊液,现在所测毒种为细胞培养增值的流感病毒,二者在RNA提取的过程中是否应有所不同? 问题2:≤250bp甚至<100bp片段的出现大多由什么原因引起?引物二聚体?还是引物特异性不好呢?还是有别的什么原因? 请各位大神不吝指导,拜托了!!! |
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求助大神予以指导啊~~~
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