| 查看: 5261 | 回复: 8 | |||
天空的蓝铜虫 (小有名气)
|
[交流]
全基因组序列比对
|
|
请问各位大神，1.5万kb长的序列在blast里怎么比对？ 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有187人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何从细菌基因组序列中钓出目的基因
已经有0人回复
- 序列比对
已经有4人回复
- 怎样从基因组测序及重测训序列比对找出突变位置
已经有5人回复
nanhu1984
银虫 (正式写手)
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 2251.2
- 散金: 13
- 红花: 13
- 帖子: 701
- 在线: 245.4小时
- 虫号: 2531775
- 注册: 2013-07-04
- 专业: 病原细菌、细菌感染与宿主
2楼2016-07-07 22:26:22
天空的蓝
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 468.5
- 散金: 58
- 帖子: 208
- 在线: 46小时
- 虫号: 1249125
- 注册: 2011-03-29
- 性别: MM
- 专业: 环境污染化学
3楼2016-07-08 09:09:44
jackyoung
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 3507.7
- 散金: 60
- 红花: 23
- 帖子: 670
- 在线: 91.7小时
- 虫号: 799178
- 注册: 2009-06-26
- 性别: GG
- 专业: 园艺学与植物营养学
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
天空的蓝: 金币+3, 很有用 2016-07-08 15:40:10
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
天空的蓝: 金币+3, 很有用 2016-07-08 15:40:10
|
15 M 的序列做blast的目的何在？ blast 的用途无非这么几种，1）查看来源和大致位置；2）计算序列的相似程度(比较适用于小片段，太大了结果也没法看，而且慢！) 如果是目的一，只需要选取两端部分序列(1kb以下，多了也没有用)在线去做就好；如果是目的二，建议使用多条序列比对的方式，用DNAMAN、SnapGene、MEGA之类的软件以目标序列和参考序列做本地比对，blast本地比对也可以，需要将参考序列做成index(formatdb)，然后做比对，在线比的意义不大。 看你研究目的了。 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-07-08 09:42:16
| 祝福 |
5楼2016-07-08 10:37:37
 |
6楼2016-07-08 10:53:31
| 祝福 |
7楼2016-07-08 11:47:29
天空的蓝
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 468.5
- 散金: 58
- 帖子: 208
- 在线: 46小时
- 虫号: 1249125
- 注册: 2011-03-29
- 性别: MM
- 专业: 环境污染化学
8楼2016-07-08 15:39:44
ygidtu
新虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1690.7
- 散金: 798
- 红花: 3
- 帖子: 419
- 在线: 117.7小时
- 虫号: 2854989
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
9楼2016-07-09 11:03:27