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y20100712

铜虫 (小有名气)

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[求助] 序列比对已有4人参与

各位大侠：我现在有一段测序后的细菌核酸，目的产物和我设计的引物不一致，想要在已经测序的全基因序列中查找这段序列，但是我的目的片段才200多bp要和庞大的全基因组比对该选用什么软件呢？还请多指教！

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提拉米苏

1楼 2013-12-12 22:11:56

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lihe131

至尊木虫 (文坛精英)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

为什么不用blast先试一下呢？

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2楼2013-12-12 23:35:08

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Gaory0906

新虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★
y20100712(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-20 10:36:13

MegAlign 这个软件很好用

搞死科研

3楼2014-06-19 22:25:40

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nwsuafliu

木虫 (著名写手)

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★
y20100712(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-20 10:36:04

NCBI中，选择你的目标物种，用你的序列直接blast啊

知识改变命运

4楼2014-06-19 23:13:05

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Doublel18

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【答案】应助回帖

我也建议你先在NCBI上Blast一下，看一下你的结果。还有就是你有你的测序结果吗

5楼2014-07-31 17:34:10

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