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y20100712

铜虫 (小有名气)

[求助] 序列比对 已有4人参与

各位大侠:我现在有一段测序后的细菌核酸,目的产物和我设计的引物不一致,想要在已经测序的全基因序列中查找这段序列,但是我的目的片段才200多bp要和庞大的全基因组比对该选用什么软件呢?还请多指教!
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提拉米苏
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nwsuafliu

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


y20100712(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-20 10:36:04
NCBI中,选择你的目标物种,用你的序列直接blast啊
知识改变命运
4楼2014-06-19 23:13:05
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lihe131

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
为什么不用blast先试一下呢?
2楼2013-12-12 23:35:08
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Gaory0906

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


y20100712(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-20 10:36:13
MegAlign 这个软件很好用
搞死科研
3楼2014-06-19 22:25:40
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Doublel18

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也建议你先在NCBI上Blast一下,看一下你的结果。还有就是你有你的测序结果吗
5楼2014-07-31 17:34:10
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