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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子模拟中想模拟不同温度，不同压强下的扩散系数，是哪里设定的？
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内涵6666

铜虫 (小有名气)

[求助] 分子模拟中想模拟不同温度，不同压强下的扩散系数，是哪里设定的？ 已有2人参与

分子模拟中想模拟不同温度，不同压强下的扩散系数，是哪里设定的？  是不是在npt退火时初始温度就是要的温度，还有nvt，nve等里面的那个温度？
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1楼 2016-07-07 14:35:38
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
内涵6666: 金币+1, ★有帮助 2016-07-07 15:57:43
建议先nvt，温度平衡后再npt，压力平衡。
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2楼2016-07-07 15:31:39
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内涵6666

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2016-07-07 15:31:39
建议先nvt，温度平衡后再npt，压力平衡。

一定要npt吗。    我是先对聚合物退火用npt    然后加入小分子，再nvt   nve算扩散系数
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3楼2016-07-07 15:59:36
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内涵6666

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2016-07-07 15:31:39
建议先nvt，温度平衡后再npt，压力平衡。

而且我的问题主要是。比如我要研究不同温度下的扩散系数，这里的温度是指哪里的温度。具体设置在哪
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4楼2016-07-07 16:02:50
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CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
内涵6666: 金币+1, ★有帮助 2016-07-07 18:55:16
先NPT，在NPT过程时设定温度、压强，NPT结束时获取合适的密度，再NVT，NVT过程时设定已经获得的密度以及与NPT相同的温度、压强。
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逆风奔跑。
5楼2016-07-07 16:25:15
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Ronny_chou

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by CQU_wjq at 2016-07-07 16:25:15
先NPT，在NPT过程时设定温度、压强，NPT结束时获取合适的密度，再NVT，NVT过程时设定已经获得的密度以及与NPT相同的温度、压强。

想请问下如果只想模拟某个温度下的吸附，那么在dynamic优化时选NVT,NVE,NPT中的哪一个啊？
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6楼2016-07-07 17:30:00
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CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-07-07 17:30:00
想请问下如果只想模拟某个温度下的吸附，那么在dynamic优化时选NVT,NVE,NPT中的哪一个啊？...

一般是NVT。
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逆风奔跑。
7楼2016-07-07 17:34:04
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 内涵6666 at 2016-07-07 15:59:36
一定要npt吗。    我是先对聚合物退火用npt    然后加入小分子，再nvt   nve算扩散系数...

如果要控制加强，当然用npt好些。如果直接npt，对压强和温度同时控制，可能会波动较大。
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8楼2016-07-07 17:52:41
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内涵6666

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by CQU_wjq at 2016-07-07 16:25:15
先NPT，在NPT过程时设定温度、压强，NPT结束时获取合适的密度，再NVT，NVT过程时设定已经获得的密度以及与NPT相同的温度、压强。

退火用npt  算不算的？
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9楼2016-07-07 18:55:11
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