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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 表面弛豫问题求助
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不取俗名

木虫 (正式写手)
引用回帖:
20楼: Originally posted by Ccfreesia at 2016-07-08 14:46:51
不是要放在不同位点，优化后比较吸附能，然后判断更倾向于吸附哪个位点么？
...

你其他位不是都优化不出来吗

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21楼2016-07-08 15:28:40
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
21楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-07-08 15:28:40
你其他位不是都优化不出来吗
...

其它位点优化后表面变形严重，这样是指这些位点的吸附不成立?可以这样理解么。。。

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22楼2016-07-08 16:42:00
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朱全喜

新虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by Ccfreesia at 2016-07-08 13:33:19
是汞原子，有人说只弛豫z方向是不科学的，除非确定在x,y方向没有发生位移，这种说法是对的么?
...

取决于你关注什么。如果关注对象就是表面几何结构以便于和实验结果相对照（比如STM或LEED等），那么肯定得全驰豫；如果是关注表面上一些高对称吸附位对最终表面性能有何影响，那么固定XY坐标就是为了提取出单一因素（吸附位）的影响作用。如果不固定，在强相互作用下它就会偏离初始位置太远，不好在不同吸附位之间作比较。

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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Ccfreesia
23楼2016-07-08 19:20:58
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朱全喜

新虫 (小有名气)
引用回帖:
22楼: Originally posted by Ccfreesia at 2016-07-08 16:42:00
其它位点优化后表面变形严重，这样是指这些位点的吸附不成立?可以这样理解么。。。
...

应该这样理解可能更好：就是你初始放置的吸附位可能只是个不稳定态，当然也有可能是亚稳态。那么你做全驰豫时，它会自动跑到能量更低的稳定态也就是你得到的变形结构。在PES（势能面）上呈现的就是吸附原子由谷顶往谷底跑。

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24楼2016-07-08 19:26:31
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
23楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-08 19:20:58
取决于你关注什么。如果关注对象就是表面几何结构以便于和实验结果相对照（比如STM或LEED等），那么肯定得全驰豫；如果是关注表面上一些高对称吸附位对最终表面性能有何影响，那么固定XY坐标就是为了提取出单一因素 ...

嗯我懂了。。万分感谢，一直都是自己摸索有很多不懂的东西，您的讲解给我的帮助很大，真的很感激

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25楼2016-07-08 23:06:46
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
23楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-08 19:20:58
取决于你关注什么。如果关注对象就是表面几何结构以便于和实验结果相对照（比如STM或LEED等），那么肯定得全驰豫；如果是关注表面上一些高对称吸附位对最终表面性能有何影响，那么固定XY坐标就是为了提取出单一因素 ...

不好意思~又来麻烦您了我选用了四层表面模型，最底层全固定，表面三层x，y方向固定，吸附分子不固定，想要用Dmol3模块进行几何优化，但对话框提示计算无法进行，请问我之前的设置出现哪些问题了呢~~
表面弛豫问题求助
IMG_20161006_203119.jpg
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26楼2016-10-08 10:50:25
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