24小时热门版块排行榜    

查看: 1813  |  回复: 25

Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

[求助] 表面弛豫问题求助 已有1人参与

研究吸附问题时,吸附剂表面的原子需要固定么,
我将表面三层弛豫,底层固定,把吸附分子放在吸附位后进行结构优化,完成后表面原子发生了位移,表面已经乱了,
是不是我做的弛豫有问题呢,还是应该改为只在z方向上弛豫???
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Pan1Peter

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Ccfreesia: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-07-06 22:09:46
就我而言,有两个方法解决,只做z方向的变化,或者是在做变化时可以勾选主geometry optimization
2楼2016-07-06 15:55:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Pan1Peter at 2016-07-06 15:55:32
就我而言,有两个方法解决,只做z方向的变化,或者是在做变化时可以勾选主geometry optimization

做变化时可以勾选主geometry optimization是什么意思呢。。。弱弱的问一句 fix  cartesian坐标和fix fractional 坐标的区别是什么啊。。。
3楼2016-07-06 21:31:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

080908010

铁杆木虫 (著名写手)

既然选择了,我们都已无法全身而退。
4楼2016-07-07 17:54:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

1. 吸附分子和基底的间距是多少?

发自小木虫Android客户端
5楼2016-07-07 18:27:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

6楼2016-07-07 18:28:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

7楼2016-07-07 18:28:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

4. 一般固定下两层,上两层relax就好了

发自小木虫Android客户端
8楼2016-07-07 18:29:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-07-07 18:27:48
1. 吸附分子和基底的间距是多少?

在不同吸附位上选的间距不同,放在hollow位和bridge位上会变乱,top位上根据分子键长取得大概值,优化后不会变乱。hollow位我直接用的create centroid,放在了中间位置,这样做有问题么,还是要通过计算把吸附分子放在与中间位置有一定距离的地方呢?
9楼2016-07-08 11:21:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-07-07 18:28:31
3. 真空层厚度

厚度是经过计算选取的,这个应该没什么问题
10楼2016-07-08 11:22:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Ccfreesia 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 3/150 2026-08-07 21:49 by shalamu
[基金申请] 基金中了 +13 laoda193707 2026-08-06 13/650 2026-08-07 20:33 by tchen18
[基金申请] 关于filecode +3 布布和一二 2026-08-07 6/300 2026-08-07 17:51 by 医学老男孩
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见