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malstose

金虫 (正式写手)

[求助] 请问,琼脂糖变性胶为何跑着就撕裂了? 已有1人参与

大家好,请问一个问题,我做的RNA变性胶(琼脂糖、MOPS及Formaldehyde的配方),电泳液为1×MOPS,电压设置为100V/3hr。
昨天只跑了2hr就发现蓝色loading buffer很淡,在凝胶的下部分裂了,上半部分正常;
今天同事又试了一次,这次跑了3hr,还是对着正极的部分撕裂变形了,而且好好的一块胶居然分两层了……,而上半部分没变化。这两次的缓冲液都是温热的,我觉得不应该是缓冲液过热的问题,我之前遇到过缓冲液烫手的情况,那样胶会部分溶解的,不会造成这种局部畸变的情况。
第一次遇见这种情况,希望有同样经历的虫友可以交流经验,在此先谢过!


请问,琼脂糖变性胶为何跑着就撕裂了?
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请问,琼脂糖变性胶为何跑着就撕裂了?-1
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请问,琼脂糖变性胶为何跑着就撕裂了?-2
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请问,琼脂糖变性胶为何跑着就撕裂了?-3
4.jpg@biostar2009@飞约疯人院
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-24 00:07:36
我们之前使用短的电泳槽时也出现这样情况,适当降低电压试试吧。

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

天空才是极限,我有信心飞的更高!
2楼2016-06-23 19:10:25
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malstose

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-06-23 19:10:25
我们之前使用短的电泳槽时也出现这样情况,适当降低电压试试吧。

图片上是用80v跑的,和用100v的结果一样。

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3楼2016-06-24 08:21:50
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malstose

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-06-23 19:10:25
我们之前使用短的电泳槽时也出现这样情况,适当降低电压试试吧。

您的意思是把电压调低就跑出来了吗,电压要调至多少?

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4楼2016-06-24 08:25:40
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

5楼2016-06-24 09:30:05
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fxy031510

铜虫 (小有名气)

应该是胶的问题
6楼2016-06-24 10:54:36
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论坛小虫虫

至尊木虫 (著名写手)

7楼2016-06-25 17:08:03
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

···
8楼2016-06-25 23:51:39
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妞—潇洒

新虫 (正式写手)

我只管面朝大海,龇牙咧嘴,至于花爱开不开
9楼2016-06-27 16:23:05
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jackyoung

新虫 (正式写手)

根据以往经验,主要原因可能是倒胶的时候MOPS 甲醛和琼脂糖胶混得不够匀,(温度和比例都要控制得当)避免有小的气泡。跑胶的时候,电压高了产热会严重,造成甲醛挥发使胶体变脆,容易变形甚至熔化。

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CestLaVie
10楼2016-06-28 07:33:36
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