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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 16s测序套峰问题
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天意怜幽草1

新虫 (初入文坛)

[求助] 16s测序套峰问题 已有1人参与

提的放线菌进行16s测序，都是套峰，怎么回事？有杂菌？

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1楼 2016-05-27 08:44:20
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有套峰，一个是样本不纯。一个是扩增体系可能污染了。
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2楼2016-05-27 09:31:16
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天意怜幽草1

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiadongliang at 2016-05-27 09:31:16
有套峰，一个是样本不纯。一个是扩增体系可能污染了。

哦哦，谢谢！

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3楼2016-05-27 20:22:23
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wangye166

新虫 (小有名气)
也可能是退火温度不合适，会有非特异性结合

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4楼2016-05-27 23:03:54
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kshdd

金虫 (著名写手)
还有一种情况是菌株有多个16s拷贝

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5楼2016-05-28 11:25:45
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uuu555000

捐助贵宾 (正式写手)
可以尝试克隆测序
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无所谓好或不好，人生一场虚空大梦，韶华白首，不过转瞬，惟有天道恒在，往复循环，不曾更改
6楼2016-05-30 07:55:01
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天意怜幽草1

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wangye166 at 2016-05-27 23:03:54
也可能是退火温度不合适，会有非特异性结合

哦哦，原来如此，谢谢哈！

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7楼2016-05-30 16:13:43
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天意怜幽草1

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by kshdd at 2016-05-28 11:25:45
还有一种情况是菌株有多个16s拷贝

哦哦，感觉应该是DNA不纯吧。你说的这方面我不太懂！谢谢哈

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8楼2016-05-30 16:14:43
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天意怜幽草1

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by uuu555000 at 2016-05-30 07:55:01
可以尝试克隆测序

嗯嗯，好的好的！

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9楼2016-05-30 16:16:28
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天意怜幽草1

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by uuu555000 at 2016-05-30 07:55:01
可以尝试克隆测序

嗯嗯，好的好的！

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10楼2016-05-30 16:16:35
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