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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 得到差异蛋白，我们能做什么
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fzhrobin

木虫 (正式写手)

[交流] 得到差异蛋白，我们能做什么

大家好！有个疑问也是困惑想请教大家
如果我得到两个植物样品（一个对照和一个逆境胁迫处理）的差异蛋白，也预测到差异蛋白它们可能的功能，那么接下来从蛋白质组学的角度研究的话，我们能做些哪方面的研究呢？
查到的文献，很多都是先做2-D电泳，找出差异蛋白，然后用软件进行分析，预测功能（或者直接通过高分辨质谱找出差异蛋白）。大多数之后没有后文了（一篇文章到此结束），要不就到了基因层面，再进行west-blot验证。如果我们从蛋白的角度出发，不涉及基因的话，我们还能做些什么研究呢？疑惑之处，请大家帮忙解答。

或者大家有新的思路，欢迎分享
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1楼 2016-05-13 09:51:41
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★
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差异蛋白GO，KEGG分类与富集；
再看富集到的GO或KEGG分类主要涉及什么功能；
如果还有文献报道表达水平，可以看一下表达水平与翻译水平的相关性；
如果要发高水平的文章，应该需要再做实验验证的吧？
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4楼2016-05-13 12:36:38
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fzhrobin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xp198766 at 2016-05-13 12:36:38
差异蛋白GO，KEGG分类与富集；
再看富集到的GO或KEGG分类主要涉及什么功能；
如果还有文献报道表达水平，可以看一下表达水平与翻译水平的相关性；
如果要发高水平的文章，应该需要再做实验验证的吧？

请问，如果做KEGG分析的话，一般能发什么档次的文章？
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7楼2016-06-13 14:03:43
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普通回帖

tan914
★
fzhrobin(金币+1): 谢谢参与
2楼2016-05-13 10:02:58
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狂狼222

禁虫 (小有名气)
★
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本帖内容被屏蔽
3楼2016-05-13 11:24:37
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爱情曼陀罗

新虫 (著名写手)
通路分析

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5楼2016-05-14 12:58:16
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Crescendo

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
研究感兴趣蛋白功能

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日拱一卒，功不唐捐
6楼2016-05-14 16:29:40
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★
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引用回帖:
7楼: Originally posted by fzhrobin at 2016-06-13 14:03:43
请问，如果做KEGG分析的话，一般能发什么档次的文章？...

这都是标准流程，不能说发什么档次的文章。一般做了组学的东西，都要涉及通路分析。如果发现新东西，好东西就高IF，如果没什么特点，就难说了
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8楼2016-06-13 14:13:41
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fzhrobin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by xp198766 at 2016-06-13 14:13:41
这都是标准流程，不能说发什么档次的文章。一般做了组学的东西，都要涉及通路分析。如果发现新东西，好东西就高IF，如果没什么特点，就难说了...

请问，通路分析对于没有一点相关基础或者说背景的人来说，上手快不快？是不是都是利用一些软件进行的分析呢？我们是刚刚起步，准备做点蛋白质组学方面的研究
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9楼2016-06-13 14:21:30
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
9楼: Originally posted by fzhrobin at 2016-06-13 14:21:30
请问，通路分析对于没有一点相关基础或者说背景的人来说，上手快不快？是不是都是利用一些软件进行的分析呢？我们是刚刚起步，准备做点蛋白质组学方面的研究...

很难啊，是个坑

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10楼2016-06-13 15:06:35
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