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笔尖上的躁动

新虫 (小有名气)

[求助] Pcr 结果测序 已有3人参与

多个,pcr样品,拿到公司单向测序,现在想把序列进行校对,有一些位点,碱基不是很固定,一个位点出现两个碱基,比如前18样品该位点为t,后面几个样品就t和a都有,我比对了波峰,后几个样品,一个位点有两个波峰,软件默认读取其中一个,这种情况,怎么办?求指教!

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sdjnyxn123

银虫 (小有名气)

一般是最前面十几个碱基和最后几个才这样吧

我做过的一般在中间都不会出现这种情况的

比较大的测序公司会把你前面不稳定的那几个删掉的,新公司一般都会给你留着,但是不会特意跟你说那几个是测不准的
4楼2016-05-09 10:02:18
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查看全部 9 个回答

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-05-12 08:13:05
笔尖上的躁动: 金币+20, 有帮助 2016-05-13 07:55:10
可能是测序误差,也可能是杂合位点。如果是同一样品的多次测序,可能是测序误差;如果多条序列都是只有这个位点不一致,考虑是杂合。
2楼2016-05-07 22:52:16
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笔尖上的躁动

新虫 (小有名气)

感谢您的回复,我只进行了一次测序,因为样品比较多,这种情况还比较多,我用手动修改么?

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3楼2016-05-09 09:06:09
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tbsjxy

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你把峰图贴出来,准不准一看便知,讨论半天没什么用
该用户由于违规已被禁言一辈子
5楼2016-05-09 11:26:43
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