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鱼虾水中游

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因敲除实验,急需帮助,谢谢啦!

我已经做基因敲除试验半年了,利用质粒pUC19构建用于基因敲除的自杀质粒,抗生素抗性基因为cm,构建好重组质粒,然后进行电转,以获得同源重组菌,重复了多次,每次都能长出几个菌落,但敲除后挑单菌落摇菌用PCR扩增,能扩增出cm片段和目的片段,但是缺失片段也能扩增出,传代几次PCR结果与之相似,而且做Western blot也能检测到目的蛋白,难道cm基因插入非目标片段处,没有同源重组掉吗?请问导致这种情况的原因是啥?如何解决?非常感谢!

[ Last edited by 鱼虾水中游 on 2016-4-27 at 17:25 ]@biostar2009
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yushin_young

新虫 (初入文坛)

能留个联系方式吗?虽然感觉你可能已经毕业了。。

我也是做的插入缺失,也遇到了同样的问题,我觉得,你扩出目的条带的原因多半是因为,在抗性的培养基中缺失株不断发生第二次交换,导致其失去抗性,所以在培养基中出现了许多死菌,所以跑PCR会跑出这样的结果,理论上应该提RNA进行反转录,这样做出来的结果更靠谱一些。
2楼2017-06-02 10:14:35
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18240090216

新虫 (初入文坛)

你好 ,想问一下这个问题解决了么?如果解决请告知,我也遇到同样的问题,亟待解决。
3楼2018-03-28 13:55:18
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