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mliwang新虫 (初入文坛)
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[求助]
在autodock上做分子对接出现的问题 已有1人参与
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我按照教程自己找大分子和小分子的mol2文件和pdb文件然后在autodock上做分子对接，然后在analyze___docking___open的时候就出现 Python 2.5.2 (r252:60911, Feb 21 2008, 13:11:45) [MSC v.1310 32 bit (Intel)] on win32 Type "copyright", "credits" or "license()" for more information. **************************************************************** Personal firewall software may warn about the connection IDLE makes to its subprocess using this computer's internal loopback interface. This connection is not visible on any external interface and no data is sent to or received from the Internet. **************************************************************** IDLE 1.2.2 ==== No Subprocess ==== >>> exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\secondautodock\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\secondautodock\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\secondautodock\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' 我对接的受体和配体还有最后打不开的dlg文件都在附件里面，希望大神们能帮我解决下，我邮箱1969671488@qq.com |
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本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 5diu.pdb
2016-04-13 09:08:48, 233.59 K
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3楼2023-02-14 20:35:11
【答案】应助回帖
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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-14 08:31:03
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-14 08:31:03
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”the "AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'" could also be related to an incomplete Dlg file (i.e. the docking didn't finished or it wasn't successful), so the script is not able to find the docked coordinates to be summarized.“ |
2楼2016-08-13 17:32:39
