| 查看: 2597 | 回复: 2 | |||
mliwang新虫 (初入文坛)
|
[求助]
在autodock上做分子对接出现的问题 已有1人参与
|
|
我按照教程自己找大分子和小分子的mol2文件和pdb文件然后在autodock上做分子对接，然后在analyze___docking___open的时候就出现 Python 2.5.2 (r252:60911, Feb 21 2008, 13:11:45) [MSC v.1310 32 bit (Intel)] on win32 Type "copyright", "credits" or "license()" for more information. **************************************************************** Personal firewall software may warn about the connection IDLE makes to its subprocess using this computer's internal loopback interface. This connection is not visible on any external interface and no data is sent to or received from the Internet. **************************************************************** IDLE 1.2.2 ==== No Subprocess ==== >>> exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\secondautodock\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\secondautodock\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\secondautodock\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' 我对接的受体和配体还有最后打不开的dlg文件都在附件里面，希望大神们能帮我解决下，我邮箱1969671488@qq.com |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 5diu.pdb
2016-04-13 09:08:48, 233.59 K
» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有88人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有15人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
【答案】应助回帖
★
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-14 08:31:03
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-14 08:31:03
|
”the "AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'" could also be related to an incomplete Dlg file (i.e. the docking didn't finished or it wasn't successful), so the script is not able to find the docked coordinates to be summarized.“ |
2楼2016-08-13 17:32:39
3楼2023-02-14 20:35:11
