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如何用discovery studio将配体和蛋白整合为一个复合物已有2人参与
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如题 如果配体和蛋白质之间结合力是氢键的话该怎么整合为一个复合物？ |
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Jiao4333303
新虫 (正式写手)
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- 专业: 微生物生理与生物化学
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成功对接后，新开一个文件，将蛋白和配体考过去，蛋白点掉locked勾勾，去掉对接时设定的半径，保存就行了 发自小木虫IOS客户端 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
yangguaiw2楼2016-04-11 10:14:21
xufund
至尊木虫 (知名作家)
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3楼2016-04-12 06:10:14
4楼2016-04-15 17:27:40
5楼2016-04-18 22:58:59
6楼2016-04-19 14:58:07
7楼2016-07-06 19:26:23
changjun
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- 专业: 天然药物化学
【答案】应助回帖
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这事我做过。 你按我的步骤来： 1、新开一个文件，将蛋白和配体考过去，删除binding site，sephere等信息，保存为pdb文件； 2、用editplus软件（是一个文本编辑软件）打开，删除最前面的二条信息，再输入下面二行的信息： HEADER protein kinase c 26-SEP-01 1A25 TITLE HUMAN protein kinase c 注意：用你的蛋白名称取代“protein kinase c”，用你的日期取代“26-SEP-01”，用你的PDBID取代“1A25”；第二行也是同样的。 3、保存为pdb文件。 最后你再用DS打开，就是一个复合物了。 |
8楼2016-10-22 17:01:17