24小时热门版块排行榜    

查看: 3248  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

jzbio

新虫 (正式写手)

[求助] 会用autoduck的大神麻烦帮我解决这个困难吧 已有4人参与

本人刚刚接触AutoDuck4.2这个分子对接软件,试图将一种酶与两个底物进行对接,在网上查了很多攻略,各种教程,按照步骤运行完毕后,生成了一个.dlg文件,但是后面在ADT菜单:Analyze →Dockings →Open … 打开对接记录文件.dlg文件却打不开,为什么呢?是因为对接失败了吗?还是什么原因?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jzbio

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by a86052 at 2016-04-07 16:07:04
难道是没有对接出来?你尝试打开时有什么提示信息吗?

ERROR *********************************************
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto
    result = command( *args, **kw )
  File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit
    d.readDlg(dlgFile)
  File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg
    self.ch = ConformationHandler(self.ligMol,
AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'
exception in _buildInputLig


显示这个错误,我做的是酶蛋白与底物小分子的对接,是不是底物与酶对接不上就不会有对接结果?
6楼2016-04-07 19:03:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

阿狸1205

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jzbio: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-04-07 15:43:38
你用记事本打开dlg文件就知道对接结果是不是出错了
2楼2016-04-07 15:18:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jzbio

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 阿狸1205 at 2016-04-07 15:18:06
你用记事本打开dlg文件就知道对接结果是不是出错了

刚刚用记事本能打开,有一大堆文字但都是乱码。
3楼2016-04-07 15:43:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

a86052

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jzbio: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-04-07 21:16:47
难道是没有对接出来?你尝试打开时有什么提示信息吗?
4楼2016-04-07 16:07:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +31 医学老男孩 2026-08-13 69/3450 2026-08-16 00:16 by mo_mo_mo_mo
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +9 majunge000 2026-08-11 11/550 2026-08-15 23:20 by botar
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见