24小时热门版块排行榜    

查看: 1303  |  回复: 11

sangnana

新虫 (初入文坛)

[求助] 兼并引物 已有1人参与

有谁知道兼并引物如何设计,求指导,谢谢谢谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

鹏蛋儿

新虫 (初入文坛)

我设计过,我是进行同源克隆的。有意可以私聊

发自小木虫Android客户端
9楼2016-04-09 18:48:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sangnana

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by tangbowen at 2016-04-07 12:43:13
找到氨基酸序列,用blockmaker划分保守区,进去codehop,设置参数,选取引物
...

问一下,这样的同源序列可以用来设计兼并引物嘛?我看了一下资料说必须要有至少6个aa的保守区,并且要有合适的距离,就是至少距离50个aa,我比对出来的有很多个保守区,只要有符合的两个保守区就可以了吧?还是必须只有两个,并且距离合适才可以
兼并引物



发自小木虫Android客户端
6楼2016-04-07 16:40:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

tangbowen

新虫 (小有名气)

2楼2016-04-06 21:10:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sangnana

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tangbowen at 2016-04-06 21:10:02
Codehop

求指教

发自小木虫Android客户端
3楼2016-04-07 09:50:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sandycool

铁虫 (正式写手)

昨天设计了一天也没设计出来

发自小木虫Android客户端
4楼2016-04-07 12:33:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tangbowen

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sangnana at 2016-04-07 09:50:51
求指教
...

找到氨基酸序列,用blockmaker划分保守区,进去codehop,设置参数,选取引物

发自小木虫IOS客户端
5楼2016-04-07 12:43:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tangbowen

新虫 (小有名气)

可以啊,我觉得相似性挺高的

发自小木虫IOS客户端
7楼2016-04-07 19:20:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

梅太奇阿拉干

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sangnana at 2016-04-07 16:40:19
问一下,这样的同源序列可以用来设计兼并引物嘛?我看了一下资料说必须要有至少6个aa的保守区,并且要有合适的距离,就是至少距离50个aa,我比对出来的有很多个保守区,只要有符合的两个保守区就可以了吧?还是必须 ...

Codehop只要有三个aa就行,软件会自己生成所有的兼并区,自己选兼并区间就行,引物选兼并度低,退火温度高,分数高的比较好,还有注意选择密码偏号表

发自小木虫Android客户端
8楼2016-04-08 23:03:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

_晚客

银虫 (小有名气)

同源克隆任重道远,加油吧

发自小木虫Android客户端
10楼2016-04-09 19:07:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sangnana 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生(3个名额)地质化工冶金领域 +57 AI8RaGaPaSCR 2026-08-07 60/3000 2026-08-14 04:45 by bxqFb8Dih2p1
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
信息提示
请填处理意见