24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1788  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

鲨鱼宝宝

新虫 (小有名气)

[求助] 多序列对比问题 已有3人参与

大家好
我想问在Multiple sequence alignment之前, 要不要把引物结合的那部分去掉。
测序的时候forward and reverse 两个方向都测了,要不要把序列拼接一下。
如果要的话,有哪些软件可以做到呢。
我现在装了clustal X 用来序列对比。
谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡维斯

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 鲨鱼宝宝 at 2016-04-06 16:43:11
我有个疑问
测序引物结合的地方测序质量很差,那段其实不准。也要保留吗?...

你是连接载体测序还是PCR产物直接测序?后者就出现这个问题,不用去,整体序列对就行,最好是连接载体,
8楼2016-04-06 17:40:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不用去掉,那就是你目的基因的一部分;
一个测序反应通常是800bp左右的长度,如果你的片段长于800就得拼接;
还有比较简单的DNAMAN可以。
2楼2016-04-04 18:52:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

半间屋

铜虫 (小有名气)

笨鸟先飞
3楼2016-04-04 22:15:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
双向测序的,最好是拼接后再比对。
拼接软件采用ContigExpress比较好。简单易用。
4楼2016-04-05 09:50:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +7 努力奋斗112 2026-04-04 7/350 2026-04-04 12:16 by 无际的草原
[考研] 283分材料与化工求调剂 +29 罗KAKA 2026-04-02 29/1450 2026-04-03 23:56 by userper
[考研] 一志愿华中农业071010,总分320求调剂 +7 困困困困坤坤 2026-04-02 7/350 2026-04-03 17:26 by Yuena_Wang
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-03 16:46 by wxiongid
[考研] 工科341分调剂 +3 洛多罗 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:20 by 1753564080
[考研] 材料专硕 调剂 +11 CXN123456 2026-04-03 11/550 2026-04-03 14:09 by 1753564080
[考研] 285求调剂 +6 FZAC123 2026-03-30 6/300 2026-04-03 12:22 by xingguangj
[基金申请] 请问共同通讯和共同一作的认可度问题 10+4 psa1234 2026-04-01 10/500 2026-04-03 11:08 by Kittylucky
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-03 10:19 by 蓝云思雨
[考研] 330求调剂 +3 白神呜呼呼 2026-04-02 3/150 2026-04-03 10:15 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿安徽大学0817化学工程与技术,求调剂 +14 我不是只因 2026-04-02 15/750 2026-04-03 09:49 by 蓝云思雨
[考研] 295求调剂 +7 愿旅途永远坦然 2026-04-02 7/350 2026-04-03 08:22 by fangshan711
[考研] 化学070300-总分378-求调剂 +5 挪椅子的泡泡糖 2026-04-02 5/250 2026-04-02 22:20 by ZXlzxl0425
[考研] 271求调剂 +15 勒布朗@ 2026-03-31 20/1000 2026-04-02 11:24 by Sammy2
[考研] 291求调剂 +20 Y-cap 2026-03-29 25/1250 2026-04-01 23:49 by 欣喜777
[考研] 298求调剂 +4 什么是胖头鱼 2026-03-30 6/300 2026-04-01 22:06 by 客尔美德
[考研] 311求调剂 +10 李芷新1 2026-03-31 10/500 2026-04-01 14:38 by chenqifeng666
[考研] 326求调剂 +4 崽崽仔 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:58 by 我的船我的海
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +6 hanamiko 2026-03-29 6/300 2026-03-31 16:35 by hypershenger
[考研] 一志愿西电085401数一英一299求调剂 六级521 +4 爱吃大鸭梨 2026-03-31 4/200 2026-03-31 11:51 by 搏击518
信息提示
请填处理意见