应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 多序列对比问题
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
51/1返回列表
查看: 1660  |  回复: 10
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

鲨鱼宝宝

新虫 (小有名气)

[求助] 多序列对比问题已有3人参与

大家好
我想问在Multiple sequence alignment之前， 要不要把引物结合的那部分去掉。
测序的时候forward and reverse 两个方向都测了，要不要把序列拼接一下。
如果要的话，有哪些软件可以做到呢。
我现在装了clustal X 用来序列对比。
谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2016-04-04 17:50:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZQC240663979

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
clustal x可以进行多序列对比的；但是一定要注意格式的问题，有些格式clustalx是不能识别的
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-05 11:29:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不用去掉，那就是你目的基因的一部分；
一个测序反应通常是800bp左右的长度，如果你的片段长于800就得拼接；
还有比较简单的DNAMAN可以。
赞一下 回复此楼
2楼2016-04-04 18:52:37
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

半间屋

铜虫 (小有名气)
NCBI也可以

发自小木虫Android客户端
回复此楼
笨鸟先飞
3楼2016-04-04 22:15:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
双向测序的，最好是拼接后再比对。
拼接软件采用ContigExpress比较好。简单易用。
赞一下 回复此楼
4楼2016-04-05 09:50:38
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭