应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 玉米引物的退货温度怎样查找？
31/1返回列表
查看: 1000  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

卫小誊

铁虫 (初入文坛)

[求助] 玉米引物的退货温度怎样查找？ 已有1人参与

老师给了一组玉米SSR引物，但是我在NCBI和http://www.maizegdb.org/上均找不到对应的退火温度。。。以前自己做得是小麦，引物退火温度挺好找的，这个一下子换做玉米就。。。求各位大神帮帮忙吧。。。小女子再此多多感谢了。。。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-04-01 16:46:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aquamarineqp

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1.有些PCR仪可以在不同的样品通道上设不同的退火温度，你可以每隔一个通道降0.2-0.5度设一个退火温度的梯度，哪个温度效果最好就用哪个
2.没有这样的PCR仪就多做几个对比试一下。
3.用你的引物在BLAST里查一下相应的扩增序列统计一下GC含量，然后推算一下，在算出来的退火温度上下1度试一下。
总之是要靠不断的试验来优化条件的。
赞一下 回复此楼
要学会生物统计
2楼2016-04-02 09:20:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卫小誊

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aquamarineqp at 2016-04-02 09:20:43
1.有些PCR仪可以在不同的样品通道上设不同的退火温度，你可以每隔一个通道降0.2-0.5度设一个退火温度的梯度，哪个温度效果最好就用哪个
2.没有这样的PCR仪就多做几个对比试一下。
3.用你的引物在BLAST里查一下相应 ...

额，那分别知道上下引物的退火温度能推测整个引物的退火温度吗？
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-02 11:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 卫小誊 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +4 Tide man 2026-08-11 4/200 2026-08-12 00:39 by liuqidi
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭