应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 玉米引物的退货温度怎样查找？
31/1返回列表
查看: 990  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

卫小誊

铁虫 (初入文坛)

[求助] 玉米引物的退货温度怎样查找？ 已有1人参与

老师给了一组玉米SSR引物，但是我在NCBI和http://www.maizegdb.org/上均找不到对应的退火温度。。。以前自己做得是小麦，引物退火温度挺好找的，这个一下子换做玉米就。。。求各位大神帮帮忙吧。。。小女子再此多多感谢了。。。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-04-01 16:46:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aquamarineqp

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1.有些PCR仪可以在不同的样品通道上设不同的退火温度，你可以每隔一个通道降0.2-0.5度设一个退火温度的梯度，哪个温度效果最好就用哪个
2.没有这样的PCR仪就多做几个对比试一下。
3.用你的引物在BLAST里查一下相应的扩增序列统计一下GC含量，然后推算一下，在算出来的退火温度上下1度试一下。
总之是要靠不断的试验来优化条件的。
赞一下 回复此楼
要学会生物统计
2楼2016-04-02 09:20:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卫小誊

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aquamarineqp at 2016-04-02 09:20:43
1.有些PCR仪可以在不同的样品通道上设不同的退火温度，你可以每隔一个通道降0.2-0.5度设一个退火温度的梯度，哪个温度效果最好就用哪个
2.没有这样的PCR仪就多做几个对比试一下。
3.用你的引物在BLAST里查一下相应 ...

额，那分别知道上下引物的退火温度能推测整个引物的退火温度吗？
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-02 11:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 卫小誊 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 听说今天filecode变了 +18 布布和一二 2026-08-06 32/1600 2026-08-07 00:37 by ywclong81
[基金申请] 基金中了 +6 laoda193707 2026-08-06 6/300 2026-08-06 23:34 by dragonxp
[基金申请] filecode +10 等待解的谜 2026-08-06 14/700 2026-08-06 21:16 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +3 archvillain 2026-08-06 7/350 2026-08-06 21:05 by archvillain
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 6/300 2026-08-06 20:19 by 苏知砚
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备？ 50+3 kf2781974 2026-07-31 12/600 2026-08-06 15:11 by eddyin
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[教师之家] 咨询面上基金 +4 李长云 2026-07-31 7/350 2026-08-06 11:20 by 李长云
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！ +22 低垂的野花 2026-07-31 30/1500 2026-08-05 18:03 by 低垂的野花
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的？有收到消息的吗？ +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[论文投稿] 十年后又回来了，论文投稿求助 +3 哈哈114477 2026-08-01 3/150 2026-08-04 15:40 by tegsgjy20
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭