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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

[交流] 钻石分子动态建模 已有2人参与

研究生毕业论文教授要求用mathematica进行分子动力学建模。 看了两本书有了大概的思路。 疑惑的是 建模第一步计算立场 计算一个分子的力场书上有基本的计算力场的方法也有一些由经验来的比如mm amber 等简化的立场。 但是钻石是晶体结构 没有分子式。我应该怎样处理这个问题,怎样来计算钻石的力场。还有公式里所有的参数在哪里能查到?  希望前辈们能给提供帮助,初来乍到给没有金币可以贡献。本人学的是机械系统工程教授给了我一个对于我来说全新的题目。希望能和大家多交流。

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Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-06 10:45:38
我们一般是先建立一个小模型,比如8*8*8,每个单位是一个标准的金刚石结构,原子坐标为
     0     0      0
     0   0.5    0.5
   0.5     0    0.5
   0.5   0.5      0
  0.25  0.25   0.25
  0.25  0. ...

请问一下为什么是这个8.8.8的坐标啊。一个晶胞不是这样的吗?下图:
钻石分子动态建模



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8楼2016-04-08 04:18:22
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Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

2楼2016-03-31 02:56:27
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Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

3楼2016-03-31 14:49:38
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abinitio

版主 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
能否再多给点信息?
钻石就是金刚石,一种结构的C,标准的金刚石结构是固定的,也很好建,如果单纯建模也不需要力场,所以:
1、你的要求就只是建出模型就可以了?还是要有后续计算?
2、你所说的模型要求多大?比如多少个原子或尺寸?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2016-04-01 08:36:46
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