24小时热门版块排行榜    

查看: 1475  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

[交流] 钻石分子动态建模 已有2人参与

研究生毕业论文教授要求用mathematica进行分子动力学建模。 看了两本书有了大概的思路。 疑惑的是 建模第一步计算立场 计算一个分子的力场书上有基本的计算力场的方法也有一些由经验来的比如mm amber 等简化的立场。 但是钻石是晶体结构 没有分子式。我应该怎样处理这个问题,怎样来计算钻石的力场。还有公式里所有的参数在哪里能查到?  希望前辈们能给提供帮助,初来乍到给没有金币可以贡献。本人学的是机械系统工程教授给了我一个对于我来说全新的题目。希望能和大家多交流。

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-06 10:45:38
我们一般是先建立一个小模型,比如8*8*8,每个单位是一个标准的金刚石结构,原子坐标为
     0     0      0
     0   0.5    0.5
   0.5     0    0.5
   0.5   0.5      0
  0.25  0.25   0.25
  0.25  0. ...

请问一下为什么是这个8.8.8的坐标啊。一个晶胞不是这样的吗?下图:
钻石分子动态建模



发自小木虫IOS客户端
8楼2016-04-08 04:18:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

2楼2016-03-31 02:56:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

3楼2016-03-31 14:49:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
能否再多给点信息?
钻石就是金刚石,一种结构的C,标准的金刚石结构是固定的,也很好建,如果单纯建模也不需要力场,所以:
1、你的要求就只是建出模型就可以了?还是要有后续计算?
2、你所说的模型要求多大?比如多少个原子或尺寸?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2016-04-01 08:36:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +17 Lanmanbaby 2026-08-09 27/1350 2026-08-11 21:12 by klxdzh
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 yPv6ndDtiRxQ 2026-08-11 4/200 2026-08-11 21:03 by thgx1vqMqrLw
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 yPv6ndDtiRxQ 2026-08-11 3/150 2026-08-11 20:51 by thgx1vqMqrLw
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +10 yufeiwaner 2026-08-09 11/550 2026-08-10 18:47 by yufeiwaner
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
请填处理意见