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钻石分子动态建模已有2人参与
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研究生毕业论文教授要求用mathematica进行分子动力学建模。 看了两本书有了大概的思路。 疑惑的是 建模第一步计算立场 计算一个分子的力场书上有基本的计算力场的方法也有一些由经验来的比如mm amber 等简化的立场。 但是钻石是晶体结构 没有分子式。我应该怎样处理这个问题，怎样来计算钻石的力场。还有公式里所有的参数在哪里能查到？ 希望前辈们能给提供帮助，初来乍到给没有金币可以贡献。本人学的是机械系统工程教授给了我一个对于我来说全新的题目。希望能和大家多交流。 发自小木虫IOS客户端 |
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送红花一朵|
谢谢你的回答，我是要用分子动力学来模拟金刚石内部原子的运动。 我看了一些关于分子动力学建模的书。 第一步就是计算分子势能也就是立场，然后用verlet来求解。其中用了周期边界条件。 关于你补充的两点： 1. 需要力场来进行后续模拟。我很困惑因为金刚石是一个晶体结构，无限的延伸下去，我要怎么计算才能算是一个分子内部势能，还是有什么简化的方法？ 2.按照周期边界条件是取一个九宫格，每个里面放置一些分子使每个格子里的分子密度和材料的分子密度保持一致。可是我这个不是一个分子啊，他是一个c一个c无限延伸下去的啊。 以上就是我很困惑的地方。谢谢指导。 发自小木虫IOS客户端 |
6楼2016-04-05 14:49:54
2楼2016-03-31 02:56:27
Masterarbeit
新虫 (初入文坛)
3楼2016-03-31 14:49:38
abinitio
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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能否再多给点信息？ 钻石就是金刚石，一种结构的C，标准的金刚石结构是固定的，也很好建，如果单纯建模也不需要力场，所以： 1、你的要求就只是建出模型就可以了？还是要有后续计算？ 2、你所说的模型要求多大？比如多少个原子或尺寸？ |
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4楼2016-04-01 08:36:46