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prthefu木虫 (著名写手)
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[求助]
从转录组得到的一段基因方向是·····还有，怎样判断得到的基因是否是全长 已有1人参与
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新手，想问一些幼稚的问题， 1. 从转录组中得到一段基因序列，这段序列的方向是从5'---3'还是3‘---5’啊？ 2. 转录组测序，得到的那些基因序列是mRNA吗？ 3. 得到的一段基因序列，如何判断是否为全长？ 4. 得到的那一段基因在ORF finder中发现翻译氨基酸的是它对应的反向互补序列，那，在扩增的时候是不是要按照反向互补序列来设计引物啊？ 5. 反向互补序列翻译氨基酸的时候，开头是起始密码子，但是在后面找不到终止密码子，这是不是说明ORF不完整，基因也不是全长啊？ |
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6楼2016-11-01 09:25:25
dsrocean
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【答案】应助回帖
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1，我觉得，基因的方向是指位于基因组的哪条链上，只要知道基因序列比对一下基因组即可。 2.广义的转录组是所有的转录的RNA，狭义的是mRNA.我理解的真核可以通过polyA得到，原核可能不全是mRNA，为去除rRNA和tRNA后的转录本。 3.全长为起始密码子至终止密码子。 4.两条链都参照。一对引物分别结合，扩增之间的双链。 5.我认为是的。 发自小木虫Android客户端 |
2楼2016-04-03 13:04:58
prthefu
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关于基因全长，我想问，我有一段基因，是有起始密码子和终止密码子，但是在里面找阅读框翻译氨基酸的时候，发现最后阅读框最后没有终止密码子，也就是阅读框不完整，那岂不是也说明基因也并不是全长啊 发自小木虫Android客户端 |
3楼2016-04-03 15:14:28
dsrocean
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4楼2016-04-05 10:07:38
