| 查看: 2212 | 回复: 4 | ||
[求助]
VASP计算，坐标原子固定方法|插件 已有2人参与
|
|
通常在计算一个体系的时候，由于晶胞比较大，原子个数多，如果采用完全驰豫的话计算太耗时，并且不容易收敛，所以通常会选择固定外围骨架原子，只选择反应活性中心的部位原子可以驰豫，我一般都是把晶胞导出POSCAR后再根据MS里面结构，一个一个查找需要驰豫的原子坐标，手动固定或者驰豫，小的还好，但是遇到多一点原子的情况，这样做太费时了还容易出错，大家通常怎么处理的？有没有好的建议呢？ 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
基金中了
已经有14人回复
-
关于filecode
已经有7人回复
-
娱乐
已经有6人回复
-
化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？
已经有4人回复
-
关于代码变化问题，想知道的进来
已经有12人回复
-
固定端突然变了，今天
已经有10人回复
-
听说今天filecode变了
已经有47人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 有关编程语言的选择
已经有4人回复
- 加强版vaspmo (v0.3) ――可视化VASP分子轨道
已经有134人回复
- MS中建立石墨烯模型导入VASP中计算
已经有10人回复
- 利用MS如何寻找ZnO的特殊K点
已经有2人回复
- 关于VASP中ISIF取值的理解
已经有2人回复
- 建立石墨烯（Graphene）的模型
已经有26人回复
- 【活动】Show 脚本，赢奖励
已经有23人回复
- 求具体操作步骤：vesta中如何构建超原胞
已经有2人回复
- 【原创】关于结构弛豫设置及收敛判据选择的一点体会
已经有140人回复
- 【原创】基于WEB浏览器的化学计算！
已经有4人回复
- 【求助完毕】Vasp中Gamma点的振动能频率是验证过度态的充要条件吗?
已经有6人回复
- 【分享】【资源】计算模拟区区刊第一期正式发布
已经有6人回复
- 计算模拟区区刊RCS第一期正式发布
已经有119人回复
- 【neweroica个人文集】最新版vaspmo (v0.1) ――可视化VASP分子轨道
已经有103人回复
- 【neweroica个人文集】原创程序 vaspmo (v0.0) ――可视化VASP的分子轨道
已经有188人回复
- 【原创】通过CASTEP产生POSCAR文件【已搜索“CASTEP”+“POSCAR”，无重复】
已经有20人回复
不取俗名
木虫 (正式写手)
- 应助: 83 (初中生)
- 金币: 2866.5
- 散金: 78
- 红花: 11
- 帖子: 676
- 在线: 84.3小时
- 虫号: 3121021
- 注册: 2014-04-08
- 专业: 理论和计算化学
2楼2016-03-29 15:50:36
|
比如说我要在Si-O-Al结构的骨架中吸附个丙酮小分子C H O ，但是骨架也有很多氧原子，我只是固定部分的原子，您说的还是不行啊，没有madeA。我在想有没有小插件好用的呢 发自小木虫Android客户端 |
3楼2016-03-29 16:02:20
未岸亡灵
铁杆木虫 (著名写手)
暂时离开小木虫
- 1ST强帖: 2
- 应助: 622 (博士)
- 金币: 6519.3
- 散金: 1221
- 红花: 111
- 帖子: 1345
- 在线: 517.8小时
- 虫号: 1730773
- 注册: 2012-04-01
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2016-03-29 17:47:44
周先森回家了
金虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2520.9
- 散金: 50
- 红花: 6
- 沙发: 3
- 帖子: 1206
- 在线: 193.8小时
- 虫号: 4537422
- 注册: 2016-03-24
- 性别: MM
- 专业: 化学工程及工业化学
5楼2016-12-08 09:26:00
100