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fangyongxinxi新虫 (正式写手)
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[求助]
求具体操作步骤：vesta中如何构建超原胞
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想建立一个2*2*2的大体系，用vasp来计算， 先自己手动建好了一个最小的原胞， 想知道能不能通过VESTA直接把原胞扩展成2*2*2的， 求具体操作步骤。 自己试过用objects-boundary-x(max)来做， 这样可以显示出超原胞的图像，但下面的坐标还是最小原胞的坐标。 郁闷 毕竟如果用手来计算这个体系的话，很容易出错。 谢谢。 |
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【答案】应助回帖
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mazuju028(金币+2): 回答细致。 2011-06-12 21:37:22
fangyongxinxi(金币+2): 2011-06-13 09:20:50
mazuju028(金币+2): 回答细致。 2011-06-12 21:37:22
fangyongxinxi(金币+2): 2011-06-13 09:20:50
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用MS先建结构，再导出。。。 。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 前几天回帖说过自己产生POSCAR文件是通过CASTEP完成的，具体过程如下： 1. 在CASTEP中把模型建好。 2. 模块中的CASTEP，计算，单击“Run”旁边的“Files...”按钮，然后点击“Save Files”按钮，弹出对话框，选“No”，将相关文件保存到project中，会出现类似计算出现的下一级文件夹。 3. 从电脑中找到此文件夹，找到***.cell文件。此文件为隐藏文件，***为MS中模型的名字。有用的为前几行，以BCC-Fe单胞为例，产生的Fe.cell文件开头内容如下： %BLOCK LATTICE_CART 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 %ENDBLOCK LATTICE_CART %BLOCK POSITIONS_FRAC Fe 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 Fe 0.5000000000000000 0.5000000000000001 0.5000000000000001 %ENDBLOCK POSITIONS_FRAC ...... 4. 书写POSCAR文件。 第一行，自定义体系名，随便自己写了，以自己方便为好 第2-5行为晶格缩放因子（晶格常数）和晶格矢量，可以有两种写法 第一种： 1.0000 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.866400000000000 第二种： 2.866400001.0000 1.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 1.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 1.000000000000000 推荐第二种写法 第6行，原子数目。应该按照种类分别写，后面坐标以及POTCAR中的顺序应与此处相同。 第7行，给出的坐标类型。“cartesian”和“direct”之分，分别是笛卡尔坐标和分数坐标，通常用第2中，分数坐标。 第8行及其以后，按照第6行原子种类排序的各个原子的分数坐标。 注：如果要考虑，部分坐标驰豫的话，需要在第7行前加入一行，“Selective dynamics”，并在各个原子坐标后，以“T”，“F”标记那个坐标需要驰豫 BCC－Fe产生POSCAR如下，具体书写格式可参考VASP Guide BCC-Fe 2.866400000000000 1.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 1.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 1.0000000000000000 2 Direct 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000000 0.5000000000000000 本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1376166 |
2楼2011-06-12 14:54:39
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