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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 求具体操作步骤：vesta中如何构建超原胞
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fangyongxinxi

新虫 (正式写手)

[求助] 求具体操作步骤：vesta中如何构建超原胞

想建立一个2*2*2的大体系，用vasp来计算，
先自己手动建好了一个最小的原胞，
想知道能不能通过VESTA直接把原胞扩展成2*2*2的，
求具体操作步骤。
自己试过用objects-boundary-x(max)来做，
这样可以显示出超原胞的图像，但下面的坐标还是最小原胞的坐标。
郁闷

毕竟如果用手来计算这个体系的话，很容易出错。
谢谢。
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1楼 2011-06-12 14:32:05
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enola

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
mazuju028(金币+2): 回答细致。 2011-06-12 21:37:22
fangyongxinxi(金币+2): 2011-06-13 09:20:50
引用回帖:
Originally posted by fangyongxinxi at 2011-06-12 14:32:05:
想建立一个2*2*2的大体系，用vasp来计算，
先自己手动建好了一个最小的原胞，
想知道能不能通过VESTA直接把原胞扩展成2*2*2的，
求具体操作步骤。
自己试过用objects-boundary-x(max)来做，
这样可以显示出超 ...

用MS先建结构，再导出。。。
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
前几天回帖说过自己产生POSCAR文件是通过CASTEP完成的，具体过程如下：
1.  在CASTEP中把模型建好。
2.  模块中的CASTEP，计算，单击“Run”旁边的“Files...”按钮，然后点击“Save Files”按钮，弹出对话框，选“No”，将相关文件保存到project中，会出现类似计算出现的下一级文件夹。
3.  从电脑中找到此文件夹，找到***.cell文件。此文件为隐藏文件，***为MS中模型的名字。有用的为前几行，以BCC-Fe单胞为例，产生的Fe.cell文件开头内容如下：
%BLOCK LATTICE_CART
       2.866400000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
       0.000000000000000       2.866400000000000       0.000000000000000
       0.000000000000000       0.000000000000000       2.866400000000000
%ENDBLOCK LATTICE_CART

%BLOCK POSITIONS_FRAC
Fe   0.0000000000000000   0.0000000000000000   0.0000000000000000
Fe   0.5000000000000000   0.5000000000000001   0.5000000000000001
%ENDBLOCK POSITIONS_FRAC
......
4.  书写POSCAR文件。
第一行，自定义体系名，随便自己写了，以自己方便为好
第2-5行为晶格缩放因子（晶格常数）和晶格矢量，可以有两种写法
第一种：
1.0000
     2.866400000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       2.866400000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       0.000000000000000       2.866400000000000
第二种：
2.866400001.0000
     1.000000000000000       0.000000000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       1.000000000000000       0.000000000000000
     0.000000000000000       0.000000000000000       1.000000000000000
推荐第二种写法
第6行，原子数目。应该按照种类分别写，后面坐标以及POTCAR中的顺序应与此处相同。
第7行，给出的坐标类型。“cartesian”和“direct”之分，分别是笛卡尔坐标和分数坐标，通常用第2中，分数坐标。
第8行及其以后，按照第6行原子种类排序的各个原子的分数坐标。
注：如果要考虑，部分坐标驰豫的话，需要在第7行前加入一行，“Selective dynamics”，并在各个原子坐标后，以“T”，“F”标记那个坐标需要驰豫
BCC－Fe产生POSCAR如下，具体书写格式可参考VASP Guide
BCC-Fe                                 
    2.866400000000000     
     1.0000000000000000    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    1.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    1.0000000000000000
   2
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.5000000000000000
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1376166
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timeflies..
2楼2011-06-12 14:54:39
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18755433781

新虫 (小有名气)
同问
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3楼2019-08-05 17:20:37
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