应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 同源模建评价问题
51/1返回列表
查看: 1646  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

陆鸿远

金虫 (小有名气)

[求助] 同源模建评价问题 已有3人参与

每次把建好的蛋白PDB格式上传SAVES网站后 想进行PROCHECK，结果就出现下面的错误  求解答及解决方法

同源模建评价问题
捕获.PNG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-03-25 09:16:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wx900901

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 陆鸿远 at 2016-03-28 16:29:56
好像不是的 我换了他的模板蛋白试了一下 结果也是这样 难道解析出的蛋白也有这种问题？...

你好，想请教一下，现在的saves 4给出的拉氏图各区域所占部分的具体数值在哪里显示？
赞一下 回复此楼
这个世界并非不好，只是我们没有见过好的罢了
4楼2016-04-22 08:40:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
陆鸿远: 金币+2, 恩 是这个原因 2016-05-20 16:35:18
是不是pdb文件有问题
赞一下 回复此楼
2楼2016-03-28 10:11:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陆鸿远

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2016-03-28 10:11:58
是不是pdb文件有问题

好像不是的 我换了他的模板蛋白试了一下 结果也是这样 难道解析出的蛋白也有这种问题？
赞一下 回复此楼
3楼2016-03-28 16:29:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

殷赋科技

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
陆鸿远: 金币+5, 你说的很对 我后来找老师帮忙解决了这个问题 用sybyl保存的就可以 2016-05-20 16:34:56
应该是PDB的问题。我在使用PROCHECK的过程中，发现某些PDB文件能用，某些PDB文件不行。采用同源模建、分子动力学模拟生成的PDB文件，经常不能用。应该是PROCHECK对PDB文件的格式有要求。建议采用多种软件转换一下。
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-22 11:25:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿华理，数一英一285求A区调剂 +6 AZMK 2026-03-25 8/400 2026-03-26 21:22 by baoball
[考研] 303求调剂 +7 元夕元 2026-03-20 8/400 2026-03-26 20:38 by 不吃魚的貓
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 材料277求调剂 +5 min3 2026-03-24 5/250 2026-03-26 15:13 by zzll406
[考研] 315分求调剂 +5 26考研上岸版26 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:11 by laoshidan
[考研] 311求调剂 +4 勇敢的小吴 2026-03-20 4/200 2026-03-25 18:12 by xcjcqu
[考研] 285求调剂 +3 AZMK 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:23 by userper
[考研] 调剂 +4 13853210211 2026-03-24 4/200 2026-03-24 19:44 by ms629
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 求调剂 +5 林之夕 2026-03-24 5/250 2026-03-24 17:16 by dick_runner
[考研] 291求调剂 +3 HanBeiNingZC 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:34 by barlinike
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[考研] 化学308分求调剂 +3 你好明天你好 2026-03-23 3/150 2026-03-23 20:11 by macy2011
[考研] 接收2026硕士调剂(学硕+专硕) +4 allen-yin 2026-03-23 6/300 2026-03-23 15:04 by 汪！？！
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭