应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 同源模建评价问题
81/1返回列表
查看: 1769  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

陆鸿远

金虫 (小有名气)

[求助] 同源模建评价问题 已有3人参与

每次把建好的蛋白PDB格式上传SAVES网站后 想进行PROCHECK，结果就出现下面的错误  求解答及解决方法

同源模建评价问题
捕获.PNG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-03-25 09:16:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
陆鸿远: 金币+2, 恩 是这个原因 2016-05-20 16:35:18
是不是pdb文件有问题
赞一下 回复此楼
2楼2016-03-28 10:11:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陆鸿远

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2016-03-28 10:11:58
是不是pdb文件有问题

好像不是的 我换了他的模板蛋白试了一下 结果也是这样 难道解析出的蛋白也有这种问题？
赞一下 回复此楼
3楼2016-03-28 16:29:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wx900901

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 陆鸿远 at 2016-03-28 16:29:56
好像不是的 我换了他的模板蛋白试了一下 结果也是这样 难道解析出的蛋白也有这种问题？...

你好，想请教一下，现在的saves 4给出的拉氏图各区域所占部分的具体数值在哪里显示？
赞一下 回复此楼
这个世界并非不好，只是我们没有见过好的罢了
4楼2016-04-22 08:40:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

殷赋科技

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
陆鸿远: 金币+5, 你说的很对 我后来找老师帮忙解决了这个问题 用sybyl保存的就可以 2016-05-20 16:34:56
应该是PDB的问题。我在使用PROCHECK的过程中，发现某些PDB文件能用，某些PDB文件不行。采用同源模建、分子动力学模拟生成的PDB文件，经常不能用。应该是PROCHECK对PDB文件的格式有要求。建议采用多种软件转换一下。
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-22 11:25:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陆鸿远

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wx900901 at 2016-04-22 08:40:32
你好，想请教一下，现在的saves 4给出的拉氏图各区域所占部分的具体数值在哪里显示？...

就在图表的下方有的
赞一下 回复此楼
6楼2016-05-20 16:33:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

许你安然然

新虫 (初入文坛)
请问楼主最后怎解决的呢？遇到同样问题，求助
赞一下 回复此楼
7楼2017-04-04 15:25:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

许你安然然

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 许你安然然 at 2017-04-04 15:25:03
请问楼主最后怎解决的呢？遇到同样问题，求助

不好意思，刚才大意没看到楼上的回复，我也是用sybyl保存就可以了，谢谢楼主
赞一下 回复此楼
8楼2017-04-04 15:51:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 陆鸿远 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 基金不中，共勉 +5 eulota 2026-08-26 5/250 2026-08-26 23:33 by young90
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +3 a089 2026-08-26 3/150 2026-08-26 23:21 by young90
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭