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18716248350

新虫 (小有名气)

[求助] crispr/cas9敲除后验证 已有2人参与

基因敲除后,验证用荧光筛选后,还要不要做surveyor错切酶法来检测?可不可以直接挑单克隆pcr与野生株比较片段长短,然后再测序?盼各位的回复
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huamao1113

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
18716248350: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-03-30 14:26:50
我们得到阳性后,就直接将靶点处的一段做PCR送测序验证,敲掉后一般都是测序验证吧…

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2016-03-25 06:45:04
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jackie在努力

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
18716248350: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-03-30 14:27:08
我用CRISPR敲除的是大肠的基因,效率比RED重组要高,我建议是通过菌落PCR+测序验证,方便快捷
16楼2016-03-29 16:05:25
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18716248350

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huamao1113 at 2016-03-25 06:45:04
我们得到阳性后,就直接将靶点处的一段做PCR送测序验证,敲掉后一般都是测序验证吧…

那样假阳性会不会很高,多测几次成本不会很高吗?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-03-25 09:32:42
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WOAIDACHANG

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4楼2016-03-27 01:10:11
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18716248350

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by WOAIDACHANG at 2016-03-27 01:10:11
楼主你是哪个学校的啊,为什么不用RED同源重组

我们老师说要用新技术!之前都没人做过,现在让我这个菜鸟搞,很恼火!

发自小木虫Android客户端
5楼2016-03-27 09:46:17
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WOAIDACHANG

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6楼2016-03-27 11:38:08
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18716248350

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by WOAIDACHANG at 2016-03-27 11:38:08
你已经敲掉了吗
...

没呢,还在连sgRNA,因为在准备试剂,在纠结要不要买那个错切酶试剂盒。

发自小木虫Android客户端
7楼2016-03-27 12:34:32
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WOAIDACHANG

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8楼2016-03-27 15:48:40
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18716248350

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by WOAIDACHANG at 2016-03-27 15:48:40
这个跟同源重组相比是不是更麻烦了。
...

我也不知道,同源重组也可以用错切酶来验证吧,应该差不多

发自小木虫Android客户端
9楼2016-03-27 16:52:00
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WOAIDACHANG

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10楼2016-03-27 19:40:17
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