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LY1199

铁虫 (小有名气)

[求助] 绝对定量PCR

目的基因片段长度 在 600多bp
材料是土壤,试剂盒提取土壤DNA,以DNA直接作为模板来做定量(有参考文献)
标准品是质粒梯度稀释而成
引物来自于参考文献中


年前做的时候 体系是 25uL的   模板2   引物2   染料 12.5  补足ddw
结果如图1 2 所示
溶解曲线是很漂亮的单峰,证明引物的特异性非常好
标准曲线  在低倍浓度时候  出现质粒污染    而且DNA浓度片段  导致样品分布在标准曲线以外


年后再做的时候 质粒污染很好控制了
结果如图 3 4 所示
 用的同样的引物 体系20uL的  引物1  模板1   燃料10
结果标准曲线可以了,但是溶解曲线出现问题   样品出现杂峰   请问这个杂峰是不是由于引物特异性不好造成的??
但是 我前后两次用的  引物是同样的(年后又让生工重新做的引物)  反应条件也没变
请问这到底是什么情况??头疼 都做快半年 了,请各位大神支支招   


目前只有7 个金币了   大家见谅

绝对定量PCR
1.png


绝对定量PCR-1
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绝对定量PCR-2
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绝对定量PCR-3
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素黑好好学习

新虫 (初入文坛)

模版有可能降解了,之前可能是加样有污染,重新做就好了

发自小木虫IOS客户端
9楼2016-03-26 18:59:10
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LY1199

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 孔名卓 at 2016-03-26 18:07:42
还有稀释的时候一定要混匀,加样的时候注意污染

嗯  问题找到了  
是DNA的问题
多谢了
10楼2016-03-26 21:49:08
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普通回帖

绿烧小鱼

新虫 (初入文坛)

我做HRM的时候也出现过这个问题,然后各种换试剂没用之后,我重新提了DNA,好了

发自小木虫Android客户端
2楼2016-03-24 00:02:56
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LY1199

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 绿烧小鱼 at 2016-03-24 00:02:56
我做HRM的时候也出现过这个问题,然后各种换试剂没用之后,我重新提了DNA,好了

那有没有可能   年前做的时候是 标准品质粒将样本DNA污染了  所以出现很标准的单峰????
3楼2016-03-24 12:33:00
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绿烧小鱼

新虫 (初入文坛)

具体不清楚,我的是在77℃,有你86℃的那种二聚体似的峰。换了新模板就没有了。初步猜测是我操作问题,经常吹打模板,导致模板有断的。你的75℃有峰,83℃有小峰,可能是有污染。你有没有反复冻融 or 吹打取样 ?

发自小木虫Android客户端
4楼2016-03-24 12:46:37
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绿烧小鱼

新虫 (初入文坛)

打错了,是我77有你83℃那种小峰

发自小木虫Android客户端
5楼2016-03-24 12:47:32
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LY1199

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 绿烧小鱼 at 2016-03-24 12:46:37
具体不清楚,我的是在77℃,有你86℃的那种二聚体似的峰。换了新模板就没有了。初步猜测是我操作问题,经常吹打模板,导致模板有断的。你的75℃有峰,83℃有小峰,可能是有污染。你有没有反复冻融 or 吹打取样 ?
...

年后做的时候, DNA都是新提取的 冻融倒是没有 因为是提取之后直接做的 一直在4度里面放的
6楼2016-03-25 09:54:58
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孔名卓

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

7楼2016-03-26 18:06:09
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孔名卓

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

8楼2016-03-26 18:07:42
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