| 查看: 1774 | 回复: 4 | |||
[求助]
gromacs软件如何计算盐桥数目 已有1人参与
|
请问gromacs软件如何计算盐桥的数目。我用g_sas这个命令得到3个xvg文件，但没有数目，而命令窗口中出现了一些氨基酸残基，但是同一个氨基撒重复出现几次，这是算一个盐桥？还是有几次算几次，详见下图 5EI8F3EGD(D5}3WET4B@]1L.png |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全
已经有6人回复
-
酰胺脱乙酰基
已经有12人回复
-
售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全
已经有3人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有4人回复
-
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有10人回复
-
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）
已经有5人回复
-
有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车
已经有5人回复
-
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优
已经有6人回复
-
面上项目申报
已经有3人回复
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
盐桥是长程力 而且还没方向限制 当然可能会一个原子出现几次…具体盐桥数据统计还的看你的截断设置为多少。 我推荐用vmd算 简单明了。 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2016-03-21 23:38:31
3楼2016-03-22 16:06:59
4楼2016-04-20 14:54:14
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
5楼2016-04-20 23:03:56