| 查看: 1823 | 回复: 4 | |||
[求助]
gromacs软件如何计算盐桥数目 已有1人参与
|
请问gromacs软件如何计算盐桥的数目。我用g_sas这个命令得到3个xvg文件，但没有数目，而命令窗口中出现了一些氨基酸残基，但是同一个氨基撒重复出现几次，这是算一个盐桥？还是有几次算几次，详见下图 5EI8F3EGD(D5}3WET4B@]1L.png |
回复此楼» 猜你喜欢
材料专业申博
已经有3人回复
-
307求调剂
已经有20人回复
-
285求调剂
已经有8人回复
-
材料与化工（0856）304求B区调剂
已经有8人回复
-
370求调剂
已经有3人回复
-
070300化学279求调剂
已经有5人回复
-
福建理工大学材料学院先进合金团队招收考研调剂学生
已经有4人回复
-
英一数一408，总分284，二战真诚求调剂
已经有5人回复
-
083000环境科学与工程调剂，总分281
已经有4人回复
-
求调剂
已经有3人回复
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
盐桥是长程力 而且还没方向限制 当然可能会一个原子出现几次…具体盐桥数据统计还的看你的截断设置为多少。 我推荐用vmd算 简单明了。 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2016-03-21 23:38:31
3楼2016-03-22 16:06:59
4楼2016-04-20 14:54:14
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
5楼2016-04-20 23:03:56
