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wyangdao木虫 (正式写手)
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gromacs软件如何计算盐桥数目 已有1人参与
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请问gromacs软件如何计算盐桥的数目。我用g_sas这个命令得到3个xvg文件，但没有数目，而命令窗口中出现了一些氨基酸残基，但是同一个氨基撒重复出现几次，这是算一个盐桥？还是有几次算几次，详见下图 5EI8F3EGD(D5}3WET4B@]1L.png |
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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盐桥是长程力 而且还没方向限制 当然可能会一个原子出现几次…具体盐桥数据统计还的看你的截断设置为多少。 我推荐用vmd算 简单明了。 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2016-03-21 23:38:31
wyangdao
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3楼2016-03-22 16:06:59
4楼2016-04-20 14:54:14
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5楼2016-04-20 23:03:56