| 查看: 1840 | 回复: 4 | ||
[求助]
gromacs软件如何计算盐桥数目 已有1人参与
|
请问gromacs软件如何计算盐桥的数目。我用g_sas这个命令得到3个xvg文件，但没有数目，而命令窗口中出现了一些氨基酸残基，但是同一个氨基撒重复出现几次，这是算一个盐桥？还是有几次算几次，详见下图 5EI8F3EGD(D5}3WET4B@]1L.png |
回复此楼» 猜你喜欢
窗边初夏的小雨
已经有6人回复
-
2026年申博-电池方向
已经有11人回复
-
26年申博自荐-计算机视觉
已经有4人回复
-
导师各种操作恶心咋办
已经有8人回复
-
2026博士申请求助
已经有5人回复
-
研究生做的很差，你们会让毕业吗？
已经有11人回复
-
求碳排放博导；方向是LCA、生命周期可持续发展以及碳排放
已经有7人回复
-
2026博士或科研助理转27年博士
已经有7人回复
-
国自科送审了吗
已经有11人回复
-
博士招生
已经有5人回复
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
盐桥是长程力 而且还没方向限制 当然可能会一个原子出现几次…具体盐桥数据统计还的看你的截断设置为多少。 我推荐用vmd算 简单明了。 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2016-03-21 23:38:31
3楼2016-03-22 16:06:59
4楼2016-04-20 14:54:14
awaken2013
铜虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 137.9
- 红花: 15
- 帖子: 243
- 在线: 149.6小时
- 虫号: 2854550
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
5楼2016-04-20 23:03:56