24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2517  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

[求助] lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么? 已有5人参与

问题是这样的:
我在nvt条件下模拟粘土对水溶液中离子的吸附,在用VMD查看结构的时候,发现粘土的结构变形很厉害,不知道是什么原因。图1和2分别是模拟初始和最终的粘土结构。可以看到最终粘土上的各原子分布混乱。
对于粘土,我只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
烦请了解的人给一些建议,不胜感激!

lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?
1.png


lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?-1
2.png
回复此楼
你若盛开清风自来
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 木子熙涵 at 2016-03-19 13:00:30
你用的是什么力场呢?

clayff力场
你若盛开清风自来
4楼2016-03-20 15:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

木子熙涵

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用的是什么力场呢?
2楼2016-03-19 13:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stormlike

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
沫水abc: 金币+3, 有帮助 2016-03-21 13:59:49
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子
3楼2016-03-19 15:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stormlike at 2016-03-19 15:12:43
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子

文献中这么说的,只计算原子间的范德华力和库伦作用力,以及粘土上羟基的振动等,其他不算,使粘土保持“rigid”,所以我不太明白这个rigid到底是啥意思?可不可以把势能参数k1、k2这些设置为0呢?
你若盛开清风自来
5楼2016-03-20 15:41:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +3 路六六jjj 2026-04-13 3/150 2026-04-13 14:50 by wunaiy88
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +20 yzyzx 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 14:50 by ajpv风雷
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +10 电气李 2026-04-13 11/550 2026-04-13 14:43 by 852137818
[考研] 085600材料与化工,求调剂 +13 won_qii 2026-04-07 13/650 2026-04-13 14:22 by 张zhihao
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +26 熊哥xtk 2026-04-07 31/1550 2026-04-13 14:22 by ajpv风雷
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +25 土豆er? 2026-04-09 28/1400 2026-04-13 14:14 by 张zhihao
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+6 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 13:40 by 北京莱茵润色
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 liuchb715 2026-04-09 5/250 2026-04-13 08:46 by 小_小_白虫
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +10 不会吃肉 2026-04-12 10/500 2026-04-12 22:51 by 零零二
[考研] 291分调剂 +5 上岸小莹加油 2026-04-09 6/300 2026-04-11 21:06 by 逆水乘风
[考研] 343求调剂 +9 王国帅 2026-04-10 9/450 2026-04-11 20:31 by dongdian1
[考研] 化学308分求调剂 +22 你好明天你好 2026-04-07 24/1200 2026-04-11 11:14 by ChemPharm
[考研] 293求调剂 +6 勇远库爱314 2026-04-08 6/300 2026-04-11 10:08 by zhq0425
[考研] 22408 352分求调剂0854类 +4 努力的夏末 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:57 by zhq0425
[考研] 301求调剂 +5 149. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 15:45 by 柴小白
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +8 bradoner 2026-04-08 9/450 2026-04-09 13:43 by only周
[考研] 353求调剂 +8 晴空万里air 2026-04-07 8/400 2026-04-09 00:18 by GouQ
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-08 3/150 2026-04-08 22:00 by zhouyuwinner
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 22:00 by hemengdong
信息提示
请填处理意见