24小时热门版块排行榜    

查看: 2694  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

[求助] lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么? 已有5人参与

问题是这样的:
我在nvt条件下模拟粘土对水溶液中离子的吸附,在用VMD查看结构的时候,发现粘土的结构变形很厉害,不知道是什么原因。图1和2分别是模拟初始和最终的粘土结构。可以看到最终粘土上的各原子分布混乱。
对于粘土,我只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
烦请了解的人给一些建议,不胜感激!

lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?
1.png


lammps 模拟粘土的吸附,发现粘土形变的厉害,请问有谁知道是什么原因么?-1
2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

你若盛开清风自来
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 木子熙涵 at 2016-03-19 13:00:30
你用的是什么力场呢?

clayff力场
你若盛开清风自来
4楼2016-03-20 15:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

木子熙涵

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用的是什么力场呢?
2楼2016-03-19 13:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stormlike

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
沫水abc: 金币+3, 有帮助 2016-03-21 13:59:49
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子
3楼2016-03-19 15:12:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沫水abc

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stormlike at 2016-03-19 15:12:43
粘土只计算了键的伸缩势能,角和二面角势能都没有计算
——那不就是跟LJ势函数差不多?
那就不是黏土,而只是气体分子而已
气体吸附了之后就是这种混乱的样子

文献中这么说的,只计算原子间的范德华力和库伦作用力,以及粘土上羟基的振动等,其他不算,使粘土保持“rigid”,所以我不太明白这个rigid到底是啥意思?可不可以把势能参数k1、k2这些设置为0呢?
你若盛开清风自来
5楼2016-03-20 15:41:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 15/750 2026-09-01 12:23 by icm639
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 21:30 by xiangy672
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见